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用于轉(zhuǎn)換和存儲多個研究的數(shù)據(jù)的系統(tǒng)和方法與流程

文檔序號:42305294發(fā)布日期:2025-07-01 19:23閱讀:6來源:國知局


背景技術(shù):

1、針對相同醫(yī)學(xué)病癥的醫(yī)學(xué)研究可能從研究中的患者處收集不同數(shù)據(jù)。這些研究可能讓患者填寫不同的臨床調(diào)查問卷。來自不同醫(yī)學(xué)研究的數(shù)據(jù)可以用于比較不同的治療選擇。可能需要訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)算法來預(yù)測研究中使用的不同治療選擇的結(jié)果。由于這些研究使用不同的方法學(xué)來收集關(guān)于患者的數(shù)據(jù),因此可能無法組合來自多個研究的數(shù)據(jù)來訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)算法。


技術(shù)實現(xiàn)思路

1、多個研究可能涉及相同或類似的醫(yī)學(xué)病癥。不同的研究可能針對醫(yī)學(xué)病癥研究不同的治療和/或治療方案。每個研究收集與參與研究的患者有關(guān)的多種信息。每個研究可能收集類似的數(shù)據(jù)和/或重疊的數(shù)據(jù),但該數(shù)據(jù)可能以不同的格式被收集。

2、為了收集與參與研究的患者有關(guān)的信息,可以給予患者臨床調(diào)查問卷。不同的研究可以使用不同的調(diào)查問卷和/或不同形式的調(diào)查問卷。例如,參與第一研究的患者可能被給予一份簡短形式版本的調(diào)查問卷,而參與第二研究的患者可能被給予一份長篇形式版本的調(diào)查問卷。即使在單個研究中,也可以使用不同的調(diào)查問卷和/或不同格式的調(diào)查問卷。

3、可以使用來自不同研究的數(shù)據(jù)訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)算法(mla)。為了準(zhǔn)備擬用于訓(xùn)練mla的數(shù)據(jù),可以將來自不同研究的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為通用格式。相同或幾乎相同的問題可以合并成標(biāo)準(zhǔn)化的格式??梢詫γ總€問題進(jìn)行分類,類似的問題可以組合。

4、可以取得來自多個研究的數(shù)據(jù),然后用于生成可以用于訓(xùn)練mla的數(shù)據(jù)集??梢詮拿總€研究中提取數(shù)據(jù)點的集合,其中每個數(shù)據(jù)點包括與個體患者對應(yīng)的數(shù)據(jù)。每個數(shù)據(jù)點可以包括從研究數(shù)據(jù)中提取的患者的多個屬性。這些屬性可以包括使用臨床調(diào)查問卷收集的數(shù)據(jù)。調(diào)查問卷中的各個問題可以從研究中提取。

5、可以基于研究中使用的調(diào)查問卷的問題來創(chuàng)建標(biāo)準(zhǔn)化的問題。研究中詢問的每個問題可以轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)化的問題之一??梢远x具有多個類別的分類法。每個標(biāo)準(zhǔn)化的問題均可以被指定分類法的一個或多個類別。標(biāo)準(zhǔn)化的問題也可以被指定標(biāo)簽。

6、兼容的問題可以被鑒定出來,因為它們被指定具有相同或類似的類別??梢詫⒓嫒莸膯栴}分組在一起并組合。分組問題的回答可以被重新調(diào)整(rescaled)為通用量表。該量表可以是分類量表或二元量表。可以基于正在組合的問題的格式確定問題的量表是分類量表還是二元量表。將組中的問題重新調(diào)整為通用量表后,可以將分組的問題組合。

7、研究數(shù)據(jù)可能有一些缺失的數(shù)據(jù)。例如,研究中的數(shù)據(jù)點可能缺失屬性值。可以填補(bǔ)該缺失的數(shù)據(jù)。如果研究中缺失的數(shù)據(jù)的量超過預(yù)先定義的閾值,則可以從研究中刪除具有大量缺失的數(shù)據(jù)的各個屬性或可以刪除整個研究。

8、在將問題組合并重新調(diào)整后,可以生成最終的數(shù)據(jù)集。最終的數(shù)據(jù)集可以分成訓(xùn)練集、驗證集和/或測試集??梢允褂糜?xùn)練集為mla選擇特征。特征可以是分類法的一個或多個類別、研究數(shù)據(jù)的屬性和/或調(diào)查問卷的回答。

9、可以使用從訓(xùn)練集中選擇的特征訓(xùn)練mla。經(jīng)過訓(xùn)練后,可以使用驗證集調(diào)整mla。然后,使用測試集測試mla。

10、根據(jù)本技術(shù)的第一廣泛方面,提供了一種方法,其包括:取得多個研究結(jié)果,其中每個研究結(jié)果包括多個數(shù)據(jù)點,并且其中每個數(shù)據(jù)點包括多個屬性;從所述多個研究結(jié)果中提取多個問題;將所述多個問題轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)化格式的問題;為所述多個問題的每一個指定一個或多個類別;基于為每個問題指定的所述一個或多個類別,確定多個問題組;確定用于所述多個組的每個組的回答量表;基于所述組的各個回答量表,重新調(diào)整所述問題組的回答;組合所述多個組的每個組的問題;填補(bǔ)所述多個研究結(jié)果中缺失的屬性值;通過組合所述多個研究結(jié)果生成最終的數(shù)據(jù)集;將所述最終的數(shù)據(jù)集分成訓(xùn)練集、驗證集和測試集;基于所述訓(xùn)練集,選擇所述訓(xùn)練集中的多個特征;和使用所述訓(xùn)練集的所述多個特征訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)算法(mla)。

11、在所述方法的一些實施方案中,所述多個問題包括來自給予參與臨床試驗的患者的臨床調(diào)查問卷中的問題。

12、在所述方法的一些實施方案中,每個數(shù)據(jù)點對應(yīng)于參與臨床試驗的患者,并且其中所述多個屬性包括給予所述患者的治療的指征。

13、在所述方法的一些實施方案中,所述多個屬性包括給予所述患者的臨床調(diào)查問卷的回答的指征。

14、在所述方法的一些實施方案中,所述多個屬性包括所述治療對所述患者是否有效的指征。

15、在所述方法的一些實施方案中,所述多個屬性包括所述患者所經(jīng)歷的副作用的指征。

16、在所述方法的一些實施方案中,所述多個屬性包括所述患者的生理數(shù)據(jù)。

17、在所述方法的一些實施方案中,所述多個屬性包括所述患者的歷史數(shù)據(jù)。

18、在所述方法的一些實施方案中,所述多個屬性包括所述患者的社會人口數(shù)據(jù)。

19、在所述方法的一些實施方案中,所述多個屬性包括所述患者的心理數(shù)據(jù)。

20、在所述方法的一些實施方案中,重新調(diào)整所述問題組的回答包括使用等百分位數(shù)縮放來重新調(diào)整所述回答。

21、根據(jù)本技術(shù)的另一廣泛方面,提供了一種方法,其包括:取得多個研究結(jié)果,其中每個研究結(jié)果包括多個數(shù)據(jù)點,并且其中每個數(shù)據(jù)點包括多個屬性;從所述多個研究結(jié)果中提取多個問題;將所述多個問題轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)化格式的問題;為所述多個問題的每一個指定一個或多個類別;確定所述多個問題的具有相同指定類別集合的問題組;組合所述問題組;通過組合所述多個研究結(jié)果生成最終的數(shù)據(jù)集;選擇所述最終的數(shù)據(jù)集中的多個特征;和使用所述多個特征訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)算法(mla)。

22、在所述方法的一些實施方案中,組合所述問題組包括:確定所述問題組的回答量表;和基于所述回答量表重新調(diào)整與所述問題組相對應(yīng)的回答。

23、根據(jù)本技術(shù)的一個更廣泛方面,提供了一種用于預(yù)測患者治療效果的方法,所述方法包括:接收來自所述患者的調(diào)查問卷回答;將所述調(diào)查問卷回答輸入根據(jù)本文所述的任何方法訓(xùn)練的mla;通過所述mla輸出所述多個治療的每一個的預(yù)測效果;基于所述多個治療的每一個的預(yù)測效果生成界面;和輸出顯示所述界面。

24、根據(jù)本技術(shù)的另一廣泛方面,提供了根據(jù)本文所述和要求保護(hù)的任何方法訓(xùn)練的經(jīng)訓(xùn)練的mla。

25、根據(jù)本技術(shù)的另一廣泛方面,提供了一種用于患者(例如用于預(yù)測治療效果)的方法,所述方法包括:通過以下步驟訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)算法(mla):取得與多個治療相對應(yīng)的多個研究結(jié)果,其中每個研究結(jié)果包括多個數(shù)據(jù)點,并且其中每個數(shù)據(jù)點包括多個屬性,從所述多個研究結(jié)果中提取多個問題,將所述多個問題轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)化格式的問題,為所述多個問題的每一個指定一個或多個類別,確定所述多個問題的具有相同指定類別集合的問題組,組合所述問題組,通過組合所述多個研究結(jié)果生成最終的數(shù)據(jù)集,和使用所述最終的數(shù)據(jù)集訓(xùn)練所述mla;接收來自所述患者的調(diào)查問卷回答;將所述調(diào)查問卷回答輸入所述mla;通過所述mla輸出所述多個治療的每一個的預(yù)測效果;基于所述多個治療的每一個的預(yù)測效果生成界面;和輸出顯示所述界面。

26、本技術(shù)的多個實施方案提供了一種基于計算機(jī)的系統(tǒng),例如,例如但不限于,包括至少一個處理器和存儲用于執(zhí)行本文所述的一種或多種方法的程序指令的存儲器的電子設(shè)備,所述程序指令由所述電子設(shè)備的所述至少一個處理器執(zhí)行。

27、應(yīng)明確理解,并非本文提及的所有技術(shù)效果均需要體現(xiàn)于本技術(shù)的每個實施方案中。

28、如本文所用,詞語“和/或”旨在表示包容性的或;例如,“x和/或y”旨在表示x或y或兩者。作為進(jìn)一步的實例,“x、y和/或z”旨在表示x或y或z或其任何組合。

29、在本說明書的上下文中,除非另有明確規(guī)定,否則計算機(jī)系統(tǒng)或計算環(huán)境可以指但不限于“電子設(shè)備”、“計算設(shè)備”、“操作系統(tǒng)”、“系統(tǒng)”、“基于計算機(jī)的系統(tǒng)”、“計算機(jī)系統(tǒng)”、“網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)”、“網(wǎng)絡(luò)設(shè)備”、“控制器單元”、“監(jiān)控設(shè)備”、“控制設(shè)備”、“服務(wù)器”和/或適合手頭相關(guān)任務(wù)的其任何組合。

30、在本說明書的上下文中,除非另有明確規(guī)定,否則本文所述的任何方法和/或系統(tǒng)均可以在基于云的環(huán)境(例如但不限于微軟azure環(huán)境、亞馬遜ec2環(huán)境和/或谷歌云環(huán)境)中實施。

31、在本說明書的上下文中,除非另有明確規(guī)定,否則表述“計算機(jī)可讀介質(zhì)”和“存儲器”旨在包括任何性質(zhì)和種類的介質(zhì),其非限制性實例包括ram、rom、磁盤(例如,cd-rom、dvd、軟盤、硬盤驅(qū)動器等)、usb密鑰、閃存卡、固態(tài)驅(qū)動器和磁帶驅(qū)動器。仍然是在本說明書的上下文中,“一種”計算機(jī)可讀介質(zhì)和“所述”計算機(jī)可讀介質(zhì)不應(yīng)被解釋為是相同的計算機(jī)可讀介質(zhì)。與之相反并在合適的時候,“一種”計算機(jī)可讀介質(zhì)和“所述”計算機(jī)可讀介質(zhì)也可以被解釋為第一計算機(jī)可讀介質(zhì)和第二計算機(jī)可讀介質(zhì)。

32、在本說明書的上下文中,除非另有明確規(guī)定,否則“第一”、“第二”、“第三”等詞語作為形容詞使用僅是為了區(qū)分它們所修飾的名詞,而不是為描述這些名詞之間的任何特定關(guān)系。

33、從以下說明書、附圖和所附權(quán)利要求中,本技術(shù)的實施方案的另外的和/或可替換的特征、方面和優(yōu)點將變得明顯。

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