本發(fā)明涉及生物。具體地,本發(fā)明涉及一種用于遞送外源目的基因至視網(wǎng)膜、特別是遞送aipl1至視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞和感光細(xì)胞的重組腺相關(guān)病毒載體。通過玻璃體內(nèi)施用或視網(wǎng)膜下施用所述重組腺相關(guān)病毒載體,在視網(wǎng)膜中能夠?qū)崿F(xiàn)外源目的基因的增加且特異性的表達(dá),由此緩解或治療leber先天性黑朦。
背景技術(shù):
1、人類超過95%的認(rèn)知活動來源于視覺,視網(wǎng)膜作為視覺處理的第一站,對于光電信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和視覺信息逐級呈遞起到了至關(guān)重要的作用。leber先天性黑朦(lca)是一種嚴(yán)重先天性致盲的視網(wǎng)膜疾病,發(fā)病年齡很早,占遺傳性視網(wǎng)膜疾病的5%以上。患病的個體在出生時或出生后的頭幾個月會被診斷患有眼球震顫、視力嚴(yán)重受損或失明,以及視網(wǎng)膜電圖異?;驘o波形。迄今為止,有20個不同的基因突變導(dǎo)致lca表型,約占所有病例的70%。這些基因包括gucy2d、rpe65、spata7、aipl1、lca5、rpgrip1、crx、crb1、nmnat1、cep290、impdh1、rd3、rdh12、lrat、tulp1、iqcb1、cluap1、prph2、kcnj13和ift140基因。
2、根據(jù)突變基因所在的染色體所處的位置,對17個lca進(jìn)行分類,其中l(wèi)eber先天性黑朦4型(lca4)主要由芳烴相互作用類蛋白1(aryl-hydrocarbon-interacting?protein-like?1,aipl1)突變引起。aipl1基因位于17號染色體,迄今為止已鑒定出79個可導(dǎo)致lca的突變。aipl1包含384個氨基酸,僅在光感受器和松果體中表達(dá)。aipl1有一個n末端fk506結(jié)合蛋白(fkbp)樣結(jié)構(gòu)域,一個三角四肽重復(fù)序列(tetratricopeptide?repeat,tpr)結(jié)構(gòu)域,以及一個在靈長類動物獨特的c末端富含脯氨酸的結(jié)構(gòu)域。aipl1突變是lca4的原因,約占lca的5.3%。
3、在視網(wǎng)膜中,aipl1作為hsp90和環(huán)核苷酸磷酸二酯酶pde6復(fù)合物的分子伴侶,是光轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中必不可少的酶效應(yīng)子。pde6被光激活后通過水解環(huán)gmp(cgmp),觸發(fā)cgmp依賴性ca2+離子通道的閉合,并通過質(zhì)膜的超極化來傳播“光”電信號。
4、aipl1基因突變破壞aipl1與hsp90或異戊二烯化pde6a(ped6復(fù)合物的一個亞基)的相互作用,影響pde6全酶的組裝,導(dǎo)致pde6亞基快速被蛋白酶體降解。pde6功能降低導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)cgmp升高,環(huán)核苷酸門控通道長時間打開和ca2+過度流入,從而導(dǎo)致光感受器退化,視力變差。
5、目前尚無批準(zhǔn)的針對lca4的治療方法,大多數(shù)情況下,治療方法僅限于視力低下的輔助治療,這些方法沒有解決基本的病理學(xué)問題,也沒有報道會改變臨床病程。因此,本領(lǐng)域需要一種能特異性感染視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞和感光細(xì)胞,并提高外源目的基因如aipl1基因表達(dá)量的用于眼部基因遞送的重組腺相關(guān)病毒載體。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明提供了一種攜帶目的基因表達(dá)框的重組aav病毒載體,所述重組aav病毒載體能特異性感染視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞和感光細(xì)胞,并提高外源目的基因如aipl1基因的表達(dá)量,由此發(fā)揮緩解或治療視網(wǎng)膜疾病(如leber先天性黑朦)的作用。
2、因此,在第一方面,本發(fā)明提供了攜帶外源目的基因的表達(dá)框,所述表達(dá)框包含欲在視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞和感光細(xì)胞特異地表達(dá)的外源目的基因和指導(dǎo)其表達(dá)的調(diào)控序列。
3、在一些實施方案中,本發(fā)明的調(diào)控序列作為分離的核酸分子,包含有效連接的:
4、a.seq?id?no:18所示的irbp增強子序列或者與其具有至少約90%同一性的增強子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的增強子序列,或者
5、seq?id?no:43所示的cmv增強子序列或者與其具有至少約90%同一性的增強子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的增強子序列,
6、b.感光細(xì)胞特異性啟動子序列,例如,所述感光細(xì)胞特異性啟動子序列選自:
7、seq?id?no:19所示的視紫紅質(zhì)激酶(rk)啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,
8、seq?id?no:44所示的hirbp啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,
9、seq?id?no:45所示的crx啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,和
10、seq?id?no:46所示的rho啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,
11、或者,
12、組成型啟動子序列,例如,所述組成型啟動子序列選自:
13、seq?id?no:47所示的cba啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,
14、seq?id?no:48所示的ef1α啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,
15、seq?id?no:49所示的ubc啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,
16、seq?id?no:50所示的cmv啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,
17、seq?id?no:51所示的sffv啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,和
18、seq?id?no:52所示的sv40啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,
19、以及
20、c.seq?id?no:20所示的cag內(nèi)含子序列、seq?id?no:53所示的ubc內(nèi)含子序列、seqid?no:54所示的人globin內(nèi)含子序列、seq?id?no:55所示的cmv內(nèi)含子序列、seq?id?no:56所示的ef1α內(nèi)含子序列;seq?id?no:57所示的cmv?globin內(nèi)含子序列、或者與它們分別具有至少約90%同一性的內(nèi)含子序列,例如,與它們分別具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的內(nèi)含子序列;
21、在一些具體實施方案中,本發(fā)明的調(diào)控序列作為分離的核酸分子包含有效連接的:
22、a.seq?id?no:18所示的irbp增強子序列或者與其具有至少約90%同一性的增強子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的增強子序列,
23、b.感光細(xì)胞特異性啟動子序列,例如,所述感光細(xì)胞特異性啟動子序列為seq?idno:19所示的視紫紅質(zhì)激酶(rk)啟動子序列,或者與其具有至少約90%同一性的啟動子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的啟動子序列,以及
24、c.seq?id?no:20所示的cag內(nèi)含子序列或者與其具有至少約90%同一性的內(nèi)含子序列,例如,與其具有約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性的內(nèi)含子序列。
25、在一些實施方案中,本發(fā)明的外源目的基因表達(dá)框包含有效連接的本發(fā)明的調(diào)控序列和外源目的基因。
26、在一些具體實施方案中,本發(fā)明的外源目的基因表達(dá)框是aipl1基因表達(dá)框。所述aipl1基因表達(dá)框包含有效連接的本發(fā)明的調(diào)控序列和編碼aipl1的核苷酸序列。例如,所述編碼aipl1的核苷酸序列為編碼seq?id?no:5所示的或與seq?id?no:4,或與seq?id?no:3具有至少約90%同一性(例如,約95%、96%、97%、98%、99%或更高的同一性)的aipl1的核苷酸序列,例如,seq?id?no:2-5所示的核苷酸序列。
27、在第二方面,本發(fā)明提供了一種核酸表達(dá)載體,所述核酸表達(dá)載體包含本發(fā)明第一方面所述的外源目的基因表達(dá)框(例如,aipl1基因表達(dá)框)。
28、在一些實施方案中,本發(fā)明的核酸表達(dá)載體在本發(fā)明第一方面所述的外源目的基因表達(dá)框(例如,aipl1基因表達(dá)框)的側(cè)翼是一個或多個反向末端重復(fù)(itr)序列,例如,兩個itr序列,分別為5’itr序列和3’itr序列。在一些實施方案中,本發(fā)明的核酸表達(dá)載體還包含聚腺苷酸化信號序列,例如,人生長激素聚腺苷酸化信號。
29、在第三方面,本發(fā)明提供了重組腺相關(guān)病毒(raav)載體,其包含衣殼和病毒載體基因組,所述病毒載體基因組從5’末端到3’末端包含5’itr序列或其變體、本發(fā)明第一方面所述的外源目的基因表達(dá)框、以及3’itr序列或其變體,任選地,兩個側(cè)翼itr之一是允許產(chǎn)生自互補病毒載體基因組的經(jīng)修飾的aavitr序列,例如,所述itr具有seq?mno:42所示的核苷酸序列。
30、在一些實施方案中,本發(fā)明的raav載體的衣殼包含以下衣殼蛋白中的任一者:aav2衣殼蛋白或其變體、aav5衣殼蛋白或其變體、aav7衣殼蛋白或其變體、aav8衣殼蛋白或其變體、aav9衣殼蛋白或其變體,
31、在一些實施方案中,本發(fā)明的raav載體的衣殼包含aav2衣殼蛋白變體,其中所述aav2衣殼蛋白變體是相對于aav2衣殼蛋白具有587-lalgdvtrpa-588插入片段(seq?id?no:28),以及i240t和v708i;或具有587-alalgdvtrpa-588插入片段(seq?id?no:32),以及i240t和v708i;其中所述氨基酸位置參考seq?id?no:38的氨基酸序列位置確定。
32、在一些實施方案中,本發(fā)明的raav載體的衣殼包含aav9衣殼蛋白變體,其中所述aav9衣殼蛋白變體是將aav9衣殼vp1的可變區(qū)viii(584-598aa)的15個功能氨基酸(hqsaqaqaqtgwvqn,seq?id?no:40)突變替換為25個特定氨基酸(lqrgnlalgdvtrparqaatadvnt,seq?id?no:41),其中所述氨基酸位置參考seq?id?no:39的氨基酸序列位置確定。
33、在第四方面,本發(fā)明提供了一種藥物,其包含本發(fā)明第一方面的基因表達(dá)框、本發(fā)明第二方面的核酸表達(dá)載體、或者本發(fā)明第三方面的raav載體。所述藥物任選地還包含可藥用載體,例如,緩沖劑、稀釋劑或賦形劑。
34、在第五方面,本發(fā)明提供了本發(fā)明第一方面的基因表達(dá)框、本發(fā)明第二方面的核酸表達(dá)載體、或者本發(fā)明第三方面的raav載體的用途,用于制備緩解或治療視網(wǎng)膜退行性眼病,例如,leber先天性黑朦的藥物組合物,優(yōu)選地,通過玻璃體內(nèi)注射或視網(wǎng)膜下注射施用所述藥物組合物。