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一種基于誘導(dǎo)型啟動(dòng)子的質(zhì)粒消除模塊的制作方法

文檔序號(hào):42326189發(fā)布日期:2025-07-01 19:44閱讀:7來源:國知局

本發(fā)明涉及基因工程領(lǐng)域,特別是針對(duì)一種基于誘導(dǎo)型啟動(dòng)子的質(zhì)粒消除模塊。


背景技術(shù):

1、游離型質(zhì)粒是動(dòng)植物、微生物細(xì)胞遺傳操作的通用平臺(tái),可用于基因組編輯、異源蛋白表達(dá)、基因電路搭建等目的。但當(dāng)使用基因組編輯或基因電路質(zhì)粒實(shí)現(xiàn)基因組編輯或基因電路設(shè)計(jì)目的后,搭載在質(zhì)粒上的基因組編輯工具或基因電路就成了細(xì)胞基因組的不穩(wěn)定因素,此時(shí)需要對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行消除,以獲得無質(zhì)粒細(xì)胞。現(xiàn)行的質(zhì)粒消除技術(shù)主要分為3種,分別是溫敏復(fù)制子質(zhì)粒消除、sacb質(zhì)粒消除以及crispr蛋白相關(guān)質(zhì)粒消除技術(shù)。

2、溫敏復(fù)制子質(zhì)粒消除效率偏低,常用于低拷貝質(zhì)粒消除,對(duì)于中高拷貝質(zhì)粒消除效果不佳。且同個(gè)細(xì)胞內(nèi)同種復(fù)制子一般只能同時(shí)服務(wù)一種質(zhì)粒,若用溫敏復(fù)制子服務(wù)多種質(zhì)粒則可能加劇質(zhì)粒的自發(fā)丟失,不利于相關(guān)實(shí)驗(yàn)或生產(chǎn)工作的開展。

3、基于sacb基因質(zhì)粒消除能同時(shí)服務(wù)于多個(gè)質(zhì)粒,但當(dāng)多種質(zhì)粒存在細(xì)胞內(nèi)時(shí),基于sacb基因的質(zhì)粒消除方法無法準(zhǔn)確的消除特定種類的質(zhì)粒,且其對(duì)突變的耐受能力較弱,容易出現(xiàn)失效的情況。

4、基于crispr蛋白的質(zhì)粒消除技術(shù)能夠同時(shí)消除多種質(zhì)粒,并自由選擇需要消除的質(zhì)粒種類,但存在crispr蛋白基因突變失效或crispr蛋白切割脫靶的風(fēng)險(xiǎn),且crispr相關(guān)蛋白元件基因序列較長,不利于在難以轉(zhuǎn)入大質(zhì)粒的底盤微生物中使用。當(dāng)?shù)妆P細(xì)胞內(nèi)無天然crispr蛋白可利用時(shí),需要額外的轉(zhuǎn)入帶有crispr蛋白的質(zhì)粒,而帶crispr蛋白的質(zhì)粒自靶向消除失敗率較高。


技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明提出了一種基于反義rna的質(zhì)粒消除技術(shù),設(shè)計(jì)了質(zhì)粒消除模塊,該模塊能促進(jìn)細(xì)胞中游離型質(zhì)粒發(fā)生丟失,能高效實(shí)現(xiàn)多種游離型質(zhì)粒的選擇消除或同步消除,能應(yīng)用于真核、原核細(xì)胞中的不同種類(拷貝數(shù))游離型質(zhì)粒的選擇消除或同步消除,對(duì)于序列突變的耐受性優(yōu)于基于crispr蛋白的質(zhì)粒消除技術(shù)。相關(guān)蛋白元件基因序列長度小于crispr,對(duì)于難以轉(zhuǎn)入大質(zhì)粒的底盤細(xì)胞依然適用。

2、針對(duì)代謝關(guān)鍵基因設(shè)計(jì)的反義rna,可以降低該代謝關(guān)鍵基因的表達(dá),從而影響細(xì)胞生長速率。在細(xì)胞擴(kuò)增和傳代時(shí),質(zhì)粒隨機(jī)分配到子代,含有這種消除模塊的質(zhì)粒的子代細(xì)胞數(shù)量會(huì)越來越少,不含有該消除模塊的質(zhì)粒的子代細(xì)胞因生長迅速會(huì)變得越來越多,從而達(dá)到富集無質(zhì)粒細(xì)胞實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒消除的目的。

3、本發(fā)明設(shè)計(jì)的質(zhì)粒消除模塊,除反義rna表達(dá)區(qū)域須部署在待消除質(zhì)粒上以外,其余區(qū)域部署于待消除質(zhì)粒所在的細(xì)胞內(nèi)即可。完成部署后,本發(fā)明設(shè)計(jì)的質(zhì)粒消除模塊可在部署范圍內(nèi)高效的實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒消除。

4、本發(fā)明的意義在于提出了一種便捷可用、可編程、適應(yīng)性廣、穩(wěn)定性強(qiáng)、所需序列較短的通用的質(zhì)粒消除模塊構(gòu)建思路,在滿足前置條件的情況下,該質(zhì)粒消除模塊可用于基因工程菌構(gòu)建后的構(gòu)建質(zhì)粒消除、人工構(gòu)建的質(zhì)粒消除。

5、為了實(shí)現(xiàn)上述目標(biāo),本發(fā)明采用如下的技術(shù)方案:

6、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,一種基于誘導(dǎo)型啟動(dòng)子的質(zhì)粒消除模塊,包括兩類相互獨(dú)立的表達(dá)區(qū)域,其中一類區(qū)域?yàn)檎T導(dǎo)因子轉(zhuǎn)錄區(qū)域,由誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子片段自帶的組成型啟動(dòng)子(包括rna聚合酶結(jié)合位點(diǎn)及轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn))、核糖體結(jié)合位點(diǎn)(rbs)、誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子翻譯區(qū)、終止子構(gòu)成;另一類區(qū)域?yàn)榉戳xrna表達(dá)區(qū)域,包括與誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子相對(duì)應(yīng)的誘導(dǎo)因子啟動(dòng)子、反義rna及終止子構(gòu)成;所述反義rna為代謝關(guān)鍵基因mrna的反義rna,能與代謝關(guān)鍵基因mrna結(jié)合阻礙代謝關(guān)鍵基因mrna翻譯。

7、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,所述的誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子為阿拉伯糖轉(zhuǎn)錄因子。

8、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,所述的誘導(dǎo)因子啟動(dòng)子為阿拉伯糖啟動(dòng)子。

9、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,所述的反義rna表達(dá)區(qū)域搭載于待消除質(zhì)粒中。

10、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,所述的待消除質(zhì)粒為細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)定游離余基因組之外的能獨(dú)立復(fù)制,或隨基因組復(fù)制并被傳遞給子代細(xì)胞的環(huán)狀或線性dna。

11、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,所述的待消除質(zhì)粒包括pet28a、pec-xk99e、酵母2μ質(zhì)粒中任意一項(xiàng)。

12、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,所述的反義rna干擾的基因?yàn)榇x關(guān)鍵基因。

13、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,所述的代謝關(guān)鍵基因?yàn)閠ca循環(huán)相關(guān)基因、蛋白質(zhì)合成相關(guān)基因、有氧呼吸相關(guān)基因、無氧呼吸相關(guān)基因、脂質(zhì)合成相關(guān)基因、細(xì)胞壁合成相關(guān)基因、糖類轉(zhuǎn)運(yùn)途徑相關(guān)基因、氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)途徑相關(guān)基因、atp合成相關(guān)基因、細(xì)胞骨架合成相關(guān)基因、nadph/nadp+合成相關(guān)基因、nadh/nad+合成相關(guān)基因、維生素合成相關(guān)基因、一碳轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)相關(guān)基因、二氧化碳固定相關(guān)基因、dna/rna合成相關(guān)基因、氨基酸合成相關(guān)基因、核糖合成相關(guān)基因、核糖體合成相關(guān)基因、核糖體組裝相關(guān)基因、氨酰trna合成酶相關(guān)基因及上述基因的同工酶基因。

14、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,所述質(zhì)粒消除模塊的消除對(duì)象為所有具備穩(wěn)定游離質(zhì)粒、游離質(zhì)粒有一定概率不會(huì)分配給子細(xì)胞、且游離質(zhì)粒消除不會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞死亡或無法增殖的微生物、動(dòng)物或植物細(xì)胞。

15、為便于本專業(yè)技術(shù)人員理解本發(fā)明,主要詞匯解釋如下:

16、基因電路:將特定的基因元件如啟動(dòng)子、終止子、蛋白質(zhì)翻譯區(qū)、特定蛋白質(zhì)結(jié)合區(qū)按照一定規(guī)律組合在一起單位點(diǎn)或多位點(diǎn)布置以實(shí)現(xiàn)特定功能的dna序列的組合。

17、便捷可用:該模塊可以以pcr產(chǎn)物/質(zhì)粒等形式保存,可通過吉布森組裝、金門克隆、酶切酶連、基因組編輯等形式插入細(xì)胞外或細(xì)胞內(nèi)的質(zhì)粒上。

18、可編程:該模塊的使用不受質(zhì)粒拷貝數(shù)限制,且可通過組合不同的調(diào)控蛋白在含有復(fù)數(shù)種質(zhì)粒的細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)選擇性消除。

19、適應(yīng)性廣:該模塊可通過密碼子優(yōu)化/替換相關(guān)控制的元件的形式跨物種使用。

20、穩(wěn)定性強(qiáng):即使反義rna與目的mrna存在一定的序列偏差也不影響本發(fā)明提出的模塊的功能。

21、所需序列較短:當(dāng)使用細(xì)胞本底調(diào)控因子時(shí),本發(fā)明提出的質(zhì)粒消除模塊序列總長通??尚∮?kbp,甚至小于100bp,當(dāng)自帶調(diào)控因子時(shí),本發(fā)明提出的質(zhì)粒消除模塊序列總長通常不會(huì)超過3kbp。

22、構(gòu)建質(zhì)粒:主要指搭在了基因組編輯必須功能蛋白用于輔助實(shí)現(xiàn)基因工程細(xì)胞基因組編輯目的的工具質(zhì)粒,這類質(zhì)粒在完成工程細(xì)胞基因組編輯后通常需要消除,以避免在工程細(xì)胞應(yīng)用中引入或造成額外的突變。

23、人工構(gòu)建質(zhì)粒:主要是指不涉及基因組編輯的、人工搭建的表達(dá)同源/異源蛋白或一些功能基因電路的質(zhì)粒。

24、質(zhì)粒的骨架:搭載質(zhì)粒復(fù)制子與質(zhì)粒維持基因的dna序列。

25、游離質(zhì)粒:能在細(xì)胞中自主輔助或隨基因組共同復(fù)制,能伴隨細(xì)胞增殖分配給子細(xì)胞,且能穩(wěn)定游離余基因組之外的線性或環(huán)狀雙鏈dna。

26、組成型啟動(dòng)子:能被大腸桿菌σ因子識(shí)別并招募rna聚合酶亞基對(duì)下游進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的特定dna序列。

27、舉例說明如下:

28、大腸桿菌相關(guān)序列:

29、大腸桿菌acnb基因干擾區(qū)全序列:

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74、pet28a質(zhì)粒全序列:

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146、tgccaccgctgagcaataactagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttgctgaaaggaggaactatatccggat(seq?id?no:2)

147、阿拉伯糖啟動(dòng)子序列(箭頭為轉(zhuǎn)錄起始方向):

148、aagaaaccaattgtccatattgcatcagacattgccgtcactgcgtcttttactggctcttctcgctaaccaaaccggtaaccccgcttattaaaagcattctgtaacaaagcgggaccaaagccatgacaaaaacgcgtaacaaaagtgtctataatcacggcagaaaagtccacattgattatttgcacggcgtcacactttgctatgccatagcatttttatccataagattagcggatcctacctgacgctttttatcgcaactctctactgtttctccat→(seq?idno:3)

149、t7終止子序列(箭頭為轉(zhuǎn)錄終止方向):

150、→ctagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttg(seq?id?no:4)

151、阿拉伯糖轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)框(包含啟動(dòng)子、cds區(qū)、終止子):

152、ggatttctgttcatgggggtaatgataccgatggcgcacatttccccgaaaagtgccacctgcatcgatttattatgacaacttgacggctacatcattcactttttcttcacaaccggcacggaactcgctcgggctggccccggtgcattttttaaatacccgcgagaaatagagttgatcgtcaaaaccaacattgcgaccgacggtggcgataggcatccgggtggtgctcaaaagcagcttcgcctggctgatacgttggtcctcgcgccagcttaagacgctaatccctaactgctggcggaaaagatgtgacagacgcgacggcgacaagcaaacatgctgtgcgacgctggcgatatcaaaattgctgtctgccaggtgatcgctgatgtactgacaagcctcgcgtacccgattatccatcggtggatggagcgactcgttaatcgcttccatgcgccgcagtaacaattgctcaagcagatttatcgccagcagctccgaatagcgcccttccccttgcccggcgttaatgatttgcccaaacaggtcgctgaaatgcggctggtgcgcttcatccgggcgaaagaaccccgtattggcaaatattgacggccagttaagccattcatgccagtaggcgcgcggacgaaagtaaacccactggtgataccattcgcgagcctccggatgacgaccgtagtgatgaatctctcctggcgggaacagcaaaatatcacccggtcggcaaacaaattctcgtccctgatttttcaccaccccctgaccgcgaatggtgagattgagaatataacctttcattcccagcggtcggtcgataaaaaaatcgagataaccgttggcctcaatcggcgttaaacccgccaccagatgggcattaaacgagtatcccggcagcaggggatcattttgcgcttcagccatacttttcatactcccgccattcagagaagaaaccaattgtccatattgcatcagacattgccgtcactgcgtcttttactggctcttctcgctaaccaaaccggtaaccccgcttattaaaagcattctgtaacaaagcgggaccaaagccatgacaaaaacgcgtaacaaaagtgtct(seq?id?no:5)

153、谷氨酸棒桿菌相關(guān)序列:

154、谷氨酸棒桿菌acn基因cds區(qū)全序列:

155、ttggagctcactgtgactgaaagcaagaactccttcaatgctaagagcacccttgaagt

156、tggcgacaagtcctatgactacttcgccctctctgcagtgcctggcatggagaagctgc

157、cgtactccctcaaggttctcggagagaaccttcttcgtaccgaagacggcgcaaacatc

158、accaacgagcacattgaggctatcgccaactgggatgcatcttccgatccaagcatcga

159、aatccagttcaccccagcccgtgttctcatgcaggacttcaccggtgtcccttgtgtagt

160、tgacctcgcaaccatgcgtgaggcagttgctgcactcggtggcgaccctaacgacgtca

161、acccactgaacccagccgagatggtcattgaccactccgtcatcgtggaggctttcggc

162、cgcccagatgcactggctaagaacgttgagatcgagtacgagcgcaacgaggagcgtt

163、accagttcctgcgttggggttccgagtccttctccaacttccgcgttgttcctccagga

164、accggtatcgtccaccaggtcaacattgagtacttggctcgcgtcgtcttcgacaacga

165、gggccttgcatacccagatacctgcatcggtaccgactcccacaccaccatggaaaacg

166、gcctgggcatcctgggctggggcgttggtggcattgaggctgaagcagcaatgctcgg

167、ccagccagtgtccatgctgatccctcgcgttgttggcttcaagttgaccggcgagatcc

168、cagtaggcgttaccgcaactgacgttgtgctgaccatcaccgaaatgctgcgcgaccac

169、ggcgtcgtccagaagttcgttgagttctacggctccggtgttaaggctgttccactggc

170、taaccgtgcaaccatcggcaacatgtccccagagttcggctccacctgtgcgatgttcc

171、caatcgacgaggagaccaccaagtacctgcgcctcaccggccgcccagaagagcaggt

172、tgcactggtcgaggcttacgccaaggcgcagggcatgtggctcgacgaggacaccgtt

173、gaagctgagtactccgagtacctcgagctggacctgtccaccgttgttccttccatcgc

174、tggccctaagcgcccacaggaccgcatccttctctccgaggcaaaggagcagttccgta

175、aggatctgccaacctacaccgacgacgctgtttccgtagacacctccatccctgcaacc

176、cgcatggttaacgaaggtggcggacagcctgaaggcggcgtcgaagctgacaactaca

177、acgcttcctgggctggctccggcgagtccttggctactggcgcagaaggacgtccttcc

178、aagccagtcaccgttgcatccccacagggtggcgagtacaccatcgaccacggcatggt

179、tgcaattgcatccatcacctcttgcaccaacacctctaacccatccgtgatgatcggcgc

180、tggcctgatcgcacgtaaggcagcagaaaagggcctcaagtccaagccttgggttaag

181、accatctgtgcaccaggttcccaggttgtcgacggctactaccagcgcgcagacctctg

182、gaaggaccttgaggccatgggcttctacctctccggcttcggctgcaccacctgtattg

183、gtaactccggcccactgccagaggaaatctccgctgcgatcaacgagcacgacctgac

184、cgcaaccgcagttttgtccggtaaccgtaacttcgagggacgtatctcccctgacgtta

185、agatgaactacctggcatccccaatcatggtcattgcttacgcaatcgctggcaccatgg

186、acttcgacttcgagaacgaagctcttggacaggaccaggacggcaacgacgtcttcct

187、gaaggacatctggccttccaccgaggaaatcgaagacaccatccagcaggcaatctcc

188、cgtgagctttacgaagctgactacgcagatgtcttcaagggtgacaagcagtggcagg

189、aactcgatgttcctaccggtgacaccttcgagtgggacgagaactccacctacatccgc

190、aaggcaccttacttcgacggcatgcctgtcgagccagtggcagtcaccgacatccaggg

191、cgcacgcgttctggctaagctcggcgactctgtcaccaccgaccacatctcccctgctt

192、cctccattaagccaggtacccctgcagctcagtacttggatgagcacggtgtggaacgc

193、cacgactacaactccctgggttccaggcgtggtaaccacgaggtcatgatgcgcggcac

194、cttcgccaacatccgcctccagaaccagctggttgacatcgcaggtggctacacccgcg

195、acttcacccaggagggtgctccacaggcgttcatctacgacgcttccgtcaactacaag

196、gctgctggcattccgctggtcgtcttgggcggcaaggagtacggcaccggttcttcccg

197、tgactgggcagctaagggcactaacctgctcggaattcgcgcagttatcaccgagtcct

198、tcgagcgtattcaccgctccaacctcatcggtatgggcgttgtcccactgcagttccctg

199、caggcgaatcccacgagtccctgggccttgacggcaccgagaccttcgacatcaccgg

200、actgaccgcactcaacgagggcgagactcctaagactgtcaaggtcaccgcaaccaag

201、gagaacggcgacgtcgtcgagttcgacgcagttgtccgcatcgacaccccaggtgagg

202、ctgactactaccgccacggcggcatcctgcagtacgtgctgcgtcagatggctgcttcttctaagtaa(seq?id?no:6)

203、谷氨酸棒桿菌pec-xk99e質(zhì)粒序列:

204、gaattcgagctcggtacccggggatcctctagagtcgacctgcaggcatgcaagcttgg

205、ctgttttggcggatgagagaagattttcagcctgatacagattaaatcagaacgcagaa

206、gcggtctgataaaacagaatttgcctggcggcagtagcgcggtggtcccacctgacccc

207、atgccgaactcagaagtgaaacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgc

208、gagagtagggaactgccaggcatcaaataaaacgaaaggctcagtcgaaagactgggc

209、ctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctcctgagtaggacaaatccgccggg

210、agcggatttgaacgttgcgaagcaacggcccggagggtggcgggcaggacgcccgcca

211、taaactgccaggcatcaaattaagcagaaggccatcctgacggatggcctttttgcgtt

212、tctacaaactctttttgtttatttttctaaatacattcaaatatgtatccgctcatgaatta

213、attccgctagatgacgtgcggcttcgacctcctgggcgtggcgcttgttggcgcgctcg

214、cggctggctgcggcacgacacgcgtctgagcagtattttgcgcgccgtcctcgtgggtc

215、aggccggggtgggatcaggccaccgcagtaggcgcagctgatgcgatcctccactactg

216、cgcgtcctcctggcgctgccgagcacgcagctcgtcggccagctcttcaaggtcggcc

217、acaagcgtttctaggtcgctcgcggcacttgcccagtcgcgtgatgctggcgcgtctgt

218、cgtatcgagggcgcggaaaaatccgatcaccgtttttaaatcgacggcggcatcgagtg

219、cgtcggactccagcgcgacatcggagagatccaccgctgatgcttcaggccagttttgg

220、tacttcgtcgtgaaggtcatgacaccattataacgaacgttcgttaaaaattctagcccc

221、aattctgataatttcttccggcactcctgcgaaaacctgcgagacttcttgcccagaaa

222、aaacgccaagcgcagcggttaccgcactttttttccaggtgatttcaccctgaccagcg

223、aagcggcactttagtgcatgaggtgtgcccctggtttcccctctttggagggttcaacc

224、caaaaaagcacacaagcaaaaatgaaaatcatcatgagcaagttggtgcgaagcagca

225、acgcgctagctccaaaaaggtctccaggatctcgaggagatttttgagggggagggag

226、tcgaggaagagccagagcagaaggcggggaaccgttctctgccgacagcgtgagccc

227、cccttaaaaatcaggccggggaggaaccggggagggatcagagctaggagcgagaca

228、ccctaaagggggggaaccgttttctgctgacggtgtttcgtttattagttttcagcccgt

229、ggatagcggagggtgagggcaagtgagagccagagcaaggacgggacccctaaaggg

230、gggaaccgttttctgctgacggtgtttcgtttattagttttcagcccgtggacggccgcg

231、tttagcttccattccaagtgcctttctgacttgttggatgcgcctttcactgacacctag

232、ttcgcctgcaagctcacgagtcgagggatcagcaaccgattgagaacgggcatccagg

233、atcgcagttttgacgcgaagttcgagcaactcgcctgtcatttctcggcgtttgtttgct

234、tccgctaatcgctgtcgcgtctcctgcgcatacttactttctgggtcagcccatctgcgt

235、gcattcgatgtagctgcgccccgtcgccccatcgtcgctagagctttccgccctcggctg

236、ctctgcgtttccacccgacgagcagggacgactggctggcctttagccacgtagccgcg

237、cacacgacgcgccatcgtcaggcgatcacgcatggcgggaagatccggctcccggccg

238、tctgcaccgaccgcctgggcaacgttgtacgccacttcatacgcgtcgatgatcttggca

239、tcttttaggcgctcaccagcagctttgagctggtatcccacggtcaacgcgtggcgaaa

240、cgcggtctcgtcgcgcgctcgctctggatttgtccagagcactcgcacgccgtcgatca

241、ggtcgccggacgcgtccagggcgctcggcaggctcgcgtccaaaatcgctagcgcctt

242、ggcttctgcggtggcgcgttgtgccgcttcaatgcgggcgcgtccgctggaaaagtcct

243、gctcaatgtactttttcggcttctgtgatccggtcatcgttcgagcaatctccattaggtc

244、ggccagccgatccacacgatcatgctggcagtgccatttataggctgtcggatcgtctga

245、gacgtgcagcggccaccggctcagcctatgcgaaaaagcctggtcagcgccgaaaaca

246、cgagtcatttcttccgtcgttgcagccagcaggcgcatatttgggctggttttacctgct

247、gcggcatacaccgggtcaatgagccagatgagctggcatttcccgctcagcggattcac

248、gccgatccaagccggcgctttttctaggcgtgcccatttctctaaaatcgcgtagacctg

249、cgggtttacgtgctcaatcttcccgccggcctggtggctgggcacatcgatgtcaagca

250、cgatcaccgcggcatgttgcgcgtgcgtcagcgcaacgtactggcaccgcgtcagcgct

251、tttgagccagcccggtagagctttggttgggtttcgccggtatccgggtttttaatccag

252、gcgctcgcgaaatctcttgtcttgctgccctggaagctttcgcgtcccaggtgagcgag

253、cagttcgcggcgatcttctgccgtccagccgcgtgagccgcagcgcatagcttcggggt

254、gggtgtcgaacagatcggcggacaatttccacgcgctagctgtgactgtgtcctgcgga

255、tcggctagagtcatgtcttgagtgctttctcccagctgatgactgggggttagccgacg

256、ccctgtgagttcccgctcacggggcgttcaactttttcaggtatttgtgcagcttatcgt

257、gttttcttcgtaaatgaacgcttaactaccttgttaaacgtggcaaataggcaggattga

258、tggggatctagcttcacgctgccgcaagcactcagggcgcaagggctgctaaaggaag

259、cggaacacgtagaaagccagtccgcagaaacggtgctgaccccggatgaatgtcagct

260、actgggctatctggacaagggaaaacgcaagcgcaaagagaaagcaggtagcttgca

261、gtgggcttacatggcgatagctagactgggcggttttatggacagcaagcgaaccggaa

262、ttgccagctggggcgccctctggtaaggttgggaagccctgcaaagtaaactggatgg

263、ctttcttgccgccaaggatctgatggcgcaggggatcaagatctgatcaagagacagga

264、tgaggatcgtttcgcatgattgaacaagatggattgcacgcaggttctccggccgcttg

265、ggtggagaggctattcggctatgactgggcacaacagacaatcggctgctctgatgccg

266、ccgtgttccggctgtcagcgcaggggcgcccggttctttttgtcaagaccgacctgtcc

267、ggtgccctgaatgaactccaagacgaggcagcgcggctatcgtggctggccacgacgg

268、gcgttccttgcgcagctgtgctcgacgttgtcactgaagcgggaagggactggctgcta

269、ttgggcgaagtgccggggcaggatctcctgtcatctcaccttgctcctgccgagaaagt

270、atccatcatggctgatgcaatgcggcggctgcatacgcttgatccggctacctgcccatt

271、cgaccaccaagcgaaacatcgcatcgagcgagcacgtactcggatggaagccggtctt

272、gtcgatcaggatgatctggacgaagagcatcaggggctcgcgccagccgaactgttcg

273、ccaggctcaaggcgcggatgcccgacggcgaggatctcgtcgtgacccatggcgatgc

274、ctgcttgccgaatatcatggtggaaaatggccgcttttctggattcatcgactgtggccg

275、gctgggtgtggcggaccgctatcaggacatagcgttggctacccgtgatattgctgaag

276、agcttggcggcgaatgggctgaccgcttcctcgtgctttacggtatcgccgctcccgatt

277、cgcagcgcatcgccttctatcgccttcttgacgagttcttctgagcgggactctggggtt

278、cgcggaatcatgaccaaaatcccttaacgtgagttttcgttccactgagcgtcagaccc

279、cgtagaaaagatcaaaggatcttcttgagatcctttttttctgcgcgtaatctgctgctt

280、gcaaacaaaaaaaccaccgctaccagcggtggtttgtttgccggatcaagagctacca

281、actctttttccgaaggtaactggcttcagcagagcgcagataccaaatactgtccttcta

282、gtgtagccgtagttaggccaccacttcaagaactctgtagcaccgcctacatacctcgct

283、ctgctaatcctgttaccagtggctgctgccagtggcgataagtcgtgtcttaccgggttg

284、gactcaagacgatagttaccggataaggcgcagcggtcgggctgaacggggggttcgt

285、gcacacagcccagcttggagcgaacgacctacaccgaactgagatacctacagcgtga

286、gctatgagaaagcgccacgcttcccgaagggagaaaggcggacaggtatccggtaagc

287、ggcagggtcggaacaggagagcgcacgagggagcttccagggggaaacgcctggtat

288、ctttatagtcctgtcgggtttcgccacctctgacttgagcgtcgatttttgtgatgctcgt

289、caggggggcggagcctatggaaaaacgccagcaacgcggcctttttacggttcctggc

290、cttttgctggccttttgctcacatgttctttcctgcgttatcccctgattctgtggataac

291、cgtattaccgcctttgagtgagctgataccgctcgccgcagccgaacgaccgagcgcag

292、cgagtcagtgagcgaggaagcggaagagcgcctgatgcggtattttctccttacgcatc

293、tgtgcggtatttcacaccgcatatggtgcactctcagtacaatctgctctgatgccgcata

294、gttaagccagtatacactccgctatcgctacgtgactgggtcatggctgcgccccgacac

295、ccgccaacacccgctgacgcgccctgacgggcttgtctgctcccggcatccgcttacag

296、acaagctgtgaccgtctccgggagctgcatgtgtcagaggttttcaccgtcatcaccga

297、aacgcgcgaggcagcagatcaattcgcgcgcgaaggcgaagcggcatgcatttacgtt

298、gacaccatcgaatggtgcaaaacctttcgcggtatggcatgatagcgcccggaagagag

299、tcaattcagggtggtgaatgtgaaaccagtaacgttatacgatgtcgcagagtatgccg

300、gtgtctcttatcagaccgtttcccgcgtggtgaaccaggccagccacgtttctgcgaaa

301、acgcgggaaaaagtggaagcggcgatggcggagctgaattacattcccaaccgcgtgg

302、cacaacaactggcgggcaaacagtcgttgctgattggcgttgccacctccagtctggcc

303、ctgcacgcgccgtcgcaaattgtcgcggcgattaaatctcgcgccgatcaactgggtgc

304、cagcgtggtggtgtcgatggtagaacgaagcggcgtcgaagcctgtaaagcggcggtg

305、cacaatcttctcgcgcaacgcgtcagtgggctgatcattaactatccgctggatgaccag

306、gatgccattgctgtggaagctgcctgcactaatgttccggcgttatttcttgatgtctctg

307、accagacacccatcaacagtattattttctcccatgaagacggtacgcgactgggcgtg

308、gagcatctggtcgcattgggtcaccagcaaatcgcgctgttagcgggcccattaagttc

309、tgtctcggcgcgtctgcgtctggctggctggcataaatatctcactcgcaatcaaattca

310、gccgatagcggaacgggaaggcgactggagtgccatgtccggttttcaacaaaccatg

311、caaatgctgaatgagggcatcgttcccactgcgatgctggttgccaacgatcagatggc

312、gctgggcgcaatgcgcgccattaccgagtccgggctgcgcgttggtgcggatatctcgg

313、tagtgggatacgacgataccgaagacagctcatgttatatcccgccgtcaaccaccatca

314、aacaggattttcgcctgctggggcaaaccagcgtggaccgcttgctgcaactctctcag

315、ggccaggcggtgaagggcaatcagctgttgcccgtctcactggtgaaaagaaaaacca

316、ccctggcgcccaatacgcaaaccgcctctccccgcgcgttggccgattcattaatgcagc

317、tggcacgacaggtttcccgactggaaagcgggcagtgagcgcaacgcaattaatgtga

318、gttagcgcgaattgatctggtttgacagcttatcatcgactgcacggtgcaccaatgctt

319、ctggcgtcaggcagccatcggaagctgtggtatggctgtgcaggtcgtaaatcactgca

320、taattcgtgtcgctcaaggcgcactcccgttctggataatgttttttgcgccgacatcata

321、acggttctggcaaatattctgaaatgagctgttgacaattaatcatccggctcgtataatgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagaccatg(seq?id?no:7)阿拉伯糖啟動(dòng)子序列(箭頭為轉(zhuǎn)錄起始方向):

322、aagaaaccaattgtccatattgcatcagacattgccgtcactgcgtcttttactggctct

323、tctcgctaaccaaaccggtaaccccgcttattaaaagcattctgtaacaaagcgggacc

324、aaagccatgacaaaaacgcgtaacaaaagtgtctataatcacggcagaaaagtccaca

325、ttgattatttgcacggcgtcacactttgctatgccatagcatttttatccataagattagcggatcctacctgacgctttttatcgcaactctctactgtttctccat→(seq?id?no:8)t7終止子序列(箭頭為轉(zhuǎn)錄終止方向):

326、→ctagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttg(seq?id?no:9)阿拉伯糖轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)框(包含啟動(dòng)子、cds區(qū)、終止子):

327、ggatttctgttcatgggggtaatgataccgatggcgcacatttccccgaaaagtgccacc

328、tgcatcgatttattatgacaacttgacggctacatcattcactttttcttcacaaccggca

329、cggaactcgctcgggctggccccggtgcattttttaaatacccgcgagaaatagagttg

330、atcgtcaaaaccaacattgcgaccgacggtggcgataggcatccgggtggtgctcaaaa

331、gcagcttcgcctggctgatacgttggtcctcgcgccagcttaagacgctaatccctaact

332、gctggcggaaaagatgtgacagacgcgacggcgacaagcaaacatgctgtgcgacgct

333、ggcgatatcaaaattgctgtctgccaggtgatcgctgatgtactgacaagcctcgcgtac

334、ccgattatccatcggtggatggagcgactcgttaatcgcttccatgcgccgcagtaacaa

335、ttgctcaagcagatttatcgccagcagctccgaatagcgcccttccccttgcccggcgtt

336、aatgatttgcccaaacaggtcgctgaaatgcggctggtgcgcttcatccgggcgaaaga

337、accccgtattggcaaatattgacggccagttaagccattcatgccagtaggcgcgcgga

338、cgaaagtaaacccactggtgataccattcgcgagcctccggatgacgaccgtagtgatg

339、aatctctcctggcgggaacagcaaaatatcacccggtcggcaaacaaattctcgtccct

340、gatttttcaccaccccctgaccgcgaatggtgagattgagaatataacctttcattccca

341、gcggtcggtcgataaaaaaatcgagataaccgttggcctcaatcggcgttaaacccgcc

342、accagatgggcattaaacgagtatcccggcagcaggggatcattttgcgcttcagccata

343、cttttcatactcccgccattcagagaagaaaccaattgtccatattgcatcagacattgc

344、cgtcactgcgtcttttactggctcttctcgctaaccaaaccggtaaccccgcttattaaa

345、agcattctgtaacaaagcgggaccaaagccatgacaaaaacgcgtaacaaaagtgtct(seq?id?no:10)

346、釀酒酵母相關(guān)序列:

347、釀酒酵母aco1/glu1基因cds區(qū)全序列:

348、atgctgtctgcacgttctgccatcaagagacccattgttcgtggtcttgcgacagtctcc

349、aacttgactagagattcaaaagtcaaccaaaacttattagaagatcattcttttattaac

350、tacaagcagaatgtggaaacgctggatatcgtaagaaaaagattaaacaggccatttac

351、ctacgcggaaaagattttgtacggtcacttggatgaccctcatggtcaagatattcagag

352、aggtgtttcatacctaaaattaagaccagatcgtgttgcctgtcaagatgctactgctca

353、aatggctattttacaatttatgtccgctggtttaccacaggttgctaagccagtcactgtc

354、cactgtgaccatttgattcaagcacaagttggtggtgaaaaagatttgaagagagctat

355、agatctaaacaaggaagtttatgatttcttggcctctgccactgcgaaatataacatggg

356、tttctggaagccaggttccggtatcattcaccaaattgttctggaaaactacgctttccc

357、aggtgctttgatcattggtactgactcccatacaccaaatgctggtggtttaggtcaatt

358、ggctattggtgttggtggtgctgatgccgttgatgttatggcaggtcgtccatgggaatt

359、gaaggctccaaagatcttaggtgttaagttgactggtaagatgaacggttggacttctc

360、caaaggatattattttgaaattggctggtatcacaactgtcaaaggtggtactggtaaaa

361、ttgttgaatatttcggtgatggtgttgacaccttctccgctactggtatgggtaccatttg

362、taatatgggtgctgaaatcggtgctaccacatctgttttcccattcaacaaatctatgatt

363、gaatatttggaagcaactggtcgtggtaagatcgctgactttgctaaattataccacaag

364、gacctattatctgctgataaggatgctgaatacgatgaggtcgtcgaaattgacttgaac

365、actctggaaccatacatcaatgggccatttacccccgatttggctactccagtttctaag

366、atgaaggaagttgctgttgctaataactggccattggatgtcagagtcggtttgatcggt

367、tcttgtaccaattcctcttatgaagatatgtctcgttcagcatccattgtcaaggatgctg

368、ctgctcatggtttgaaatccaagaccattttcactgttactccaggttctgaacaaatca

369、gagccactattgaacgtgatggccaattagaaaccttcaaagaatttggtggtatcgttt

370、tggcaaacgcctgtggcccatgtattggtcaatgggatcgtagagatatcaagaaaggt

371、gacaagaatactatcgtttcctcttacaacagaaatttcacttctagaaatgatggtaac

372、ccacaaactcatgcttttgttgcatctccagaattagtaactgcgttcgccattgcgggt

373、gatttgagattcaaccctctaacagacaaattaaaggacaaggatggtaatgagttcat

374、gttgaaaccaccacatggtgatggtttgcctcaaagaggttatgatgctggtgagaaca

375、cttaccaagctccacctgcagaccgtagcaccgttgaagttaaagtttctccaacttca

376、gaccgtctacaactgttgaaaccattcaaaccttgggatggtaaggatgctaaagacat

377、gccaatcttgattaaggccgtcggtaagacaactactgatcatatttctatggctggtcca

378、tggttgaaatacagaggtcatttagaaaacatttctaataactatatgattggtgctatta

379、atgctgaaaacaagaaggctaactgtgttaaaaatgtatatactggtgaatacaaaggt

380、gttccagacactgctagagattacagagaccaaggtatcaagtgggttgttattggtga

381、tgaaaactttggtgaaggttcctctcgtgaacacgctgctttggaaccaagattcttgg

382、gcggtttcgctatcatcacaaagtctttcgctcgtatccatgaaactaacttgaaaaaac

383、aaggtctattgccattgaacttcaagaacccagctgactatgacaagatcaaccctgat

384、gacagaatcgatattctgggtctagctgaattggctccaggtaagcctgtaacaatgag

385、agttcatccaaagaatggtaagccatgggatgctgtgttgacccatactttcaacgatga

386、gcaaattgaatggttcaaatatggttctgccttaaataaaattaaggccgatgagaagaaataa(seqid?no:11)

387、釀酒酵母2μ穿梭質(zhì)粒序列:

388、caactttgtatagaaaagttgacggattagaagccgccgagcgggtgacagccctccga

389、aggaagactctcctccgtgcgtcctcgtcttcaccggtcgcgttcctgaaacgcagatg

390、tgcctcgcgccgcactgctccgaacaataaagattctacaatactagcttttatggttatg

391、aagaggaaaaattggcagtaacctggccccacaaaccttcaaatgaacgaatcaaatt

392、aacaaccataggatgataatgcgattagttttttagccttatttctggggtaattaatcag

393、cgaagcgatgatttttgatctattaacagatatataaatgcaaaaactgcataaccacttt

394、aactaatactttcaacattttcggtttgtattacttcttattcaaatgtaataaaagtatca

395、acaaaaaattgttaatatacctctatactttaacgtcaaggagaaaaaacccaagtttgt

396、acaaaaaagcaggctgccaccatggtgagcaagggcgaggagctgttcaccggggtg

397、gtgcccatcctggtcgagctggacggcgacgtaaacggccacaagttcagcgtgtccg

398、gcgagggcgagggcgatgccacctacggcaagctgaccctgaagttcatctgcaccac

399、cggcaagctgcccgtgccctggcccaccctcgtgaccaccctgacctacggcgtgcagt

400、gcttcagccgctaccccgaccacatgaagcagcacgacttcttcaagtccgccatgccc

401、gaaggctacgtccaggagcgcaccatcttcttcaaggacgacggcaactacaagaccc

402、gcgccgaggtgaagttcgagggcgacaccctggtgaaccgcatcgagctgaagggcat

403、cgacttcaaggaggacggcaacatcctggggcacaagctggagtacaactacaacagc

404、cacaacgtctatatcatggccgacaagcagaagaacggcatcaaggtgaacttcaagat

405、ccgccacaacatcgaggacggcagcgtgcagctcgccgaccactaccagcagaacacc

406、cccatcggcgacggccccgtgctgctgcccgacaaccactacctgagcacccagtccgc

407、cctgagcaaagaccccaacgagaagcgcgatcacatggtcctgctggagttcgtgacc

408、gccgccgggatcactctcggcatggacgagctgtacaagtaaacccagctttcttgtac

409、aaagtggtagcggccgctcgagcatgcatctagagggccgcatcatgtaattagttatgt

410、cacgcttacattcacgccctccccccacatccgctctaaccgaaaaggaaggagttaga

411、caacctgaagtctaggtccctatttatttttttatagttatgttagtattaagaacgttatt

412、tatatttcaaatttttcttttttttctgtacagacgcgtgtacgcatgtaacattatactga

413、aaaccttgcttgagaaggttttgggacgctcgaaggctttaatttgcaagctgcggccc

414、tgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgggcgctcttcc

415、gcttcctcgctcactgactcgctgcgctcggtcgttcggctgcggcgagcggtatcagc

416、tcactcaaaggcggtaatacggttatccacagaatcaggggataacgcaggaaagaaca

417、tgtgagcaaaaggccagcaaaaggccaggaaccgtaaaaaggccgcgttgctggcgt

418、ttttccataggctccgcccccctgacgagcatcacaaaaatcgacgctcaagtcagagg

419、tggcgaaacccgacaggactataaagataccaggcgtttccccctggaagctccctcgt

420、gcgctctcctgttccgaccctgccgcttaccggatacctgtccgcctttctcccttcggg

421、aagcgtggcgctttctcatagctcacgctgtaggtatctcagttcggtgtaggtcgttcg

422、ctccaagctgggctgtgtgcacgaaccccccgttcagcccgaccgctgcgccttatccg

423、gtaactatcgtcttgagtccaacccggtaagacacgacttatcgccactggcagcagcc

424、actggtaacaggattagcagagcgaggtatgtaggcggtgctacagagttcttgaagtg

425、gtggcctaactacggctacactagaagaacagtatttggtatctgcgctctgctgaagcc

426、agttaccttcggaaaaagagttggtagctcttgatccggcaaacaaaccaccgctggta

427、gcggtggtttttttgtttgcaagcagcagattacgcgcagaaaaaaaggatctcaagaa

428、gatcctttgatcttttctacggggtctgacgctcagtggaacgaaaactcacgttaagg

429、gattttggtcatgagattatcaaaaaggatcttcacctagatccttttaaattaaaaatga

430、agttttaaatcaatctaaagtatatatgagtaaacttggtctgacagttaccaatgcttaa

431、tcagtgaggcacctatctcagcgatctgtctatttcgttcatccatagttgcctgactccc

432、cgtcgtgtagataactacgatacgggagggcttaccatctggccccagtgctgcaatgat

433、accgcgagacccacgctcaccggctccagatttatcagcaataaaccagccagccggaa

434、gggccgagcgcagaagtggtcctgcaactttatccgcctccatccagtctattaattgtt

435、gccgggaagctagagtaagtagttcgccagttaatagtttgcgcaacgttgttgccatt

436、gctacaggcatcgtggtgtcacgctcgtcgtttggtatggcttcattcagctccggttcc

437、caacgatcaaggcgagttacatgatcccccatgttgtgcaaaaaagcggttagctcctt

438、cggtcctccgatcgttgtcagaagtaagttggccgcagtgttatcactcatggttatggc

439、agcactgcataattctcttactgtcatgccatccgtaagatgcttttctgtgactggtgag

440、tactcaaccaagtcattctgagaatagtgtatgcggcgaccgagttgctcttgcccggc

441、gtcaatacgggataataccgcgccacatagcagaactttaaaagtgctcatcattggaaa

442、acgttcttcggggcgaaaactctcaaggatcttaccgctgttgagatccagttcgatgt

443、aacccactcgtgcacccaactgatcttcagcatcttttactttcaccagcgtttctgggt

444、gagcaaaaacaggaaggcaaaatgccgcaaaaaagggaataagggcgacacggaaat

445、gttgaatactcatactcttcctttttcaatgggtaataactgatataattaaattgaagctc

446、taatttgtgagttgagtatacatgcatttacttataatacagtttttcagaagaactcgtc

447、aagaaggcgatagaaggcgatgcgctgcgaatcgggagcggcgataccgtaaagcacg

448、aggaagcggtcagcccattcgccgccaagctcttcagcaatatcacgggtagccaacgc

449、tatgtcctgatagcggtccgccacacccagccggccacagtcgatgaatccagaaaagc

450、ggccattttccaccatgatattcggcaagcaggcatcgccatgggtcacgacgagatcct

451、cgccgtcgggcatgctcgccttgagcctggcgaacagttcggctggcgcgagcccctga

452、tgctcttcgtccagatcatcctgatcgacaagaccggcttccatccgagtacgtgctcgc

453、tcgatgcgatgtttcgcttggtggtcgaatgggcaggtagccggatcaagcgtatgcag

454、ccgccgcattgcatcagccatgatggatactttctcggcaggagcaaggtgagatgaca

455、ggagatcctgccccggcacttcgcccaatagcagccagtcccttcccgcttcagtgaca

456、acgtcgagcacagctgcgcaaggaacgcccgtcgtggccagccacgatagccgcgctg

457、cctcgtcttgcagttcattcagggcaccggacaggtcggtcttgacaaaaagaaccgg

458、gcgcccctgcgctgacagccggaacacggcggcatcagagcagccgattgtctgttgt

459、gcccagtcatagccgaatagcctctccacccaagcggccggagaacctgcgtgcaatcc

460、atcttgttcaatcatgatttatcttcgtttcctgcaggtttttgttctgtgcagttgggtt

461、aagaatactgggcaatttcatgtttctttcaacactacatatgcgtatatataccaatctaa

462、gtctgtgctccttccttcgttcttccttctgttcggagattaccgaatcaaaaaaatttc

463、aaggaaaccgaaatcaaaaaaaagaataaaaaaaaaatgatgaattgaaaagctagct

464、tatcgatgataagctgtcaaacatgagaattaattccacggactatagactatacctagta

465、tactccgtctactgtacgatacacttccgctcaggtccttgtcctttaacgaggccttac

466、cactcttttgttactctattgatccagctcagcaaaggcagtgtgatctaagattctatct

467、tcgcgatgtagtaaaactagctagaccgagaaagagactagaaatgcaaaaggcactt

468、ctacaatggctgccatcattattatccgatgtgacgctgcagcttctcaatgatattcgaa

469、tacgctttgaggagatacagcctaatatccgacaaactgttttacagatttacgatcgta

470、cttgttacccatcattgaattttgaacatccgaacctgggagttttccctgaaacagata

471、gtatatttgaacctgtataataatatatagtctagcgctttacggaagacaatgtatgtatt

472、tcggttcctggagaaactattgcatctattgcataggtaatcttgcacgtcgcatccccg

473、gttcattttctgcgtttccatcttgcacttcaatagcatatctttgttaacgaagcatctg

474、tgcttcattttgtagaacaaaaatgcaacgcgagagcgctaatttttcaaacaaagaat

475、ctgagctgcatttttacagaacagaaatgcaacgcgaaagcgctattttaccaacgaag

476、aatctgtgcttcatttttgtaaaacaaaaatgcaacgcgagagcgctaatttttcaaaca

477、aagaatctgagctgcatttttacagaacagaaatgcaacgcgagagcgctattttacca

478、acaaagaatctatacttcttttttgttctacaaaaatgcatcccgagagcgctatttttct

479、aacaaagcatcttagattactttttttctcctttgtgcgctctataatgcagtctcttgat

480、aactttttgcactgtaggtccgttaaggttagaagaaggctactttggtgtctattttct

481、cttccataaaaaaagcctgactccacttcccgcgtttactgattactagcgaagctgcgg

482、gtgcattttttcaagataaaggcatccccgattatattctataccgatgtggattgcgcat

483、actttgtgaacagaaagtgatagcgttgatgattcttcattggtcagaaaattatgaacg

484、gtttcttctattttgtctctatatactacgtataggaaatgtttacattttcgtattgttttc

485、gattcactctatgaatagttcttactacaatttttttgtctaaagagtaatactagagata

486、aacataaaaaatgtagaggtcgagtttagatgcaagttcaaggagcgaaaggtggatg

487、ggtaggttatatagggatatagcacagagatatatagcaaagagatacttttgagcaatgt

488、ttgtggaagcggtattcgcaatgggaagctccaccccggttgataatcagaaaagcccc

489、aaaaacaggaagattgtataagcaaatatttaaattgtaagcgttaatattttgttaaaat

490、tcgcgttaaatttttgttaaatcagctcattttttaaccaataggccgaaatcggcaaaat

491、cccttataaatcaaaagaatagaccgagatagggttgagtgttgttccagtttggaaca

492、agagtccactattaaagaacgtggactccaacgtcaaagggcgaaaaaccgtctatca

493、gggcgatggcccactacgtgaaccatcaccctaatcaagttttttggggtcgaggtgcc

494、gtaaagcactaaatcggaaccctaaagggagcccccgatttagagcttgacggggaaa

495、gccggcgaacgtggcgagaaaggaagggaagaaagcgaaaggagcgggcgctaggg

496、cgctggcaagtgtagcggtcacgctgcgcgtaaccaccacacccgccgcgcttaatgcgccgctacagggcgcgtggggatcgatccactagt(seq?id?no:12)

497、釀酒酵母硫酸新霉素抗性基因序列(包含啟動(dòng)子、表達(dá)框、終止子):gtgagttgagtatacatgcatttacttataatacagtttttcagaagaactcgtcaagaaggcgatagaaggcgatgcgctgcgaatcgggagcggcgataccgtaaagcacgaggaagcggtcagcccattcgccgccaagctcttcagcaatatcacgggtagccaacgctatgtcctgatagcggtccgccacacccagccggccacagtcgatgaatccagaaaagcggccattttccaccatgatattcggcaagcaggcatcgccatgggtcacgacgagatcctcgccgtcgggcatgctcgccttgagcctggcgaacagttcggctggcgcgagcccctgatgctcttcgtccagatcatcctgatcgacaagaccggcttccatccgagtacgtgctcgctcgatgcgatgtttcgcttggtggtcgaatgggcaggtagccggatcaagcgtatgcagccgccgcattgcatcagccatgatggatactttctcggcaggagcaaggtgagatgacaggagatcctgccccggcacttcgcccaatagcagccagtcccttcccgcttcagtgacaacgtcgagcacagctgcgcaaggaacgcccgtcgtggccagccacgatagccgcgctgcctcgtcttgcagttcattcagggcaccggacaggtcggtcttgacaaaaagaaccgggcgcccctgcgctgacagccggaacacggcggcatcagagcagccgattgtctgttgtgcccagtcatagccgaatagcctctccacccaagcggccggagaacctgcgtgcaatccatcttgttcaatcatgatttatcttcgtttcctgcaggtttttgttctgtgcagttgggttaagaatactgggcaatttcatgtttctttcaacactacatatgcgtatatataccaatctaagtctgtgctccttccttcgttcttccttctg(seq?id?no:13)

498、穿梭載體大腸桿菌復(fù)制子序列:

499、tttccataggctccgcccccctgacgagcatcacaaaaatcgacgctcaagtcagaggt

500、ggcgaaacccgacaggactataaagataccaggcgtttccccctggaagctccctcgtg

501、cgctctcctgttccgaccctgccgcttaccggatacctgtccgcctttctcccttcggga

502、agcgtggcgctttctcatagctcacgctgtaggtatctcagttcggtgtaggtcgttcgc

503、tccaagctgggctgtgtgcacgaaccccccgttcagcccgaccgctgcgccttatccgg

504、taactatcgtcttgagtccaacccggtaagacacgacttatcgccactggcagcagcca

505、ctggtaacaggattagcagagcgaggtatgtaggcggtgctacagagttcttgaagtgg

506、tggcctaactacggctacactagaagaacagtatttggtatctgcgctctgctgaagcca

507、gttaccttcggaaaaagagttggtagctcttgatccggcaaacaaaccaccgctggtag

508、cggtggtttttttgtttgcaagcagcagattacgcgcagaaaaaaaggatctcaa(seq?id?no:14)

509、穿梭載體氨芐青霉素抗性基因表達(dá)框(包含啟動(dòng)子、表達(dá)框、終止子):ggatcttcacctagatccttttaaattaaaaatgaagttttaaatcaatctaaagtatatatgagtaaacttggtctgacagttaccaatgcttaatcagtgaggcacctatctcagcgatctgtctatttcgttcatccatagttgcctgactccccgtcgtgtagataactacgatacgggagggcttaccatctggccccagtgctgcaatgataccgcgagacccacgctcaccggctccagatttatcagcaataaaccagccagccggaagggccgagcgcagaagtggtcctgcaactttatccgcctccatccagtctattaattgttgccgggaagctagagtaagtagttcgccagttaatagtttgcgcaacgttgttgccattgctacaggcatcgtggtgtcacgctcgtcgtttggtatggcttcattcagctccggttcccaacgatcaaggcgagttacatgatcccccatgttgtgcaaaaaagcggttagctccttcggtcctccgatcgttgtcagaagtaagttggccgcagtgttatcactcatggttatggcagcactgcataattctcttactgtcatgccatccgtaagatgcttttctgtgactggtgagtactcaaccaagtcattctgagaatagtgtatgcggcgaccgagttgctcttgcccggcgtcaatacgggataataccgcgccacatagcagaactttaaaagtgctcatcattggaaaacgttcttcggggcgaaaactctcaaggatcttaccgctgttgagatccagttcgatgtaacccactcgtgcacccaactgatcttcagcatcttttactttcaccagcgtttctgggtgagcaaaaacaggaaggcaaaatgccgcaaaaaagggaataagggcgacacggaaatgttgaatactcatactcttcctttttcaatgggtaataactgatataattaaattgaagctctaatttgtgagttgagtatacatgc(seq?id?no:15)

510、釀酒酵母誘導(dǎo)型啟動(dòng)子gal1序列:

511、acggattagagccgccgagcgacgagcgagcggagcgcagcagcgccgaaggaagac

512、tctcctccgtgcgctcctcgtctcgtcttcaccggtcgtcgtcctgaaacgagatgtgtg

513、cctcgcgccgcactgctccgaacaataatacaataaagattctacaatactagctatggtt

514、atggttatgaagagaaaaatggcagtacctggccccaaacctcaaatgaacgaatcaat

515、taacaaccataggatgatgataatgcgattagttagcttattctatttctggggtaattaat

516、cagcgaagcgatgatgattttgatctattacagatatataatgcaaaactgcataaccact

517、taactaactaatataatactttcaacattttcgtgttgattacttcttatcaaatgtaatacaaaaattgtaatatatacctatactactactacttaacgtcaaggagacc(seq?id?no:16)酵母終止子cyc1序列:

518、atcatgtaattagttatgtcacgcttacattcacgccctccccccacatccgctctaaccg

519、aaaaggaaggagttagacaacctgaagtctaggtccctatttatttttttatagttatgtt

520、agtattaagaacgttatttatatttcaaatttttcttttttttctgtacagacgcgtgtacg

521、catgtaacattatactgaaaaccttgcttgagaaggttttgggacgctcgaaggctttaatttgcaagct(seq?id?no:17)

522、本發(fā)明的有益效果在于:

523、本發(fā)明設(shè)計(jì)了一種基于反義rna的、模塊化的質(zhì)粒消除技術(shù),構(gòu)建質(zhì)粒消除模塊所需元件簡單易得,質(zhì)粒模塊消除效率高,可根據(jù)需要自由設(shè)置消除對(duì)象,可實(shí)現(xiàn)多種質(zhì)粒的選擇性或同步消除。且本發(fā)明應(yīng)用范圍廣,真核原核生物中均可應(yīng)用該技術(shù),中心代謝途徑相關(guān)基因皆可結(jié)合反義rna用于質(zhì)粒消除,中心代謝途徑之外的氨基酸、核酸、脂質(zhì)合成途徑、轉(zhuǎn)錄翻譯、dna復(fù)制、細(xì)胞壁、細(xì)胞膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等代謝相關(guān)基因的反義rna同樣可應(yīng)用于本技術(shù),還可通過增加反義rna種類、延長反義rna長度等策略強(qiáng)化消除效果。

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