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一種基于級(jí)聯(lián)反應(yīng)的質(zhì)粒消除模塊的制作方法

文檔序號(hào):42326191發(fā)布日期:2025-07-01 19:44閱讀:7來(lái)源:國(guó)知局

本發(fā)明涉及基因工程領(lǐng)域,特別是針對(duì)一種基于級(jí)聯(lián)反應(yīng)的質(zhì)粒消除模塊。


背景技術(shù):

1、游離型質(zhì)粒是動(dòng)植物、微生物細(xì)胞遺傳操作的通用平臺(tái),可用于基因組編輯、異源蛋白表達(dá)、基因電路搭建等目的。但當(dāng)使用基因組編輯或基因電路質(zhì)粒實(shí)現(xiàn)基因組編輯或基因電路設(shè)計(jì)目的后,搭載在質(zhì)粒上的基因組編輯工具或基因電路就成了細(xì)胞基因組的不穩(wěn)定因素,此時(shí)需要對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行消除,以獲得無(wú)質(zhì)粒細(xì)胞?,F(xiàn)行的質(zhì)粒消除技術(shù)主要分為3種,分別是溫敏復(fù)制子質(zhì)粒消除、sacb質(zhì)粒消除以及crispr蛋白相關(guān)質(zhì)粒消除技術(shù)。

2、溫敏復(fù)制子質(zhì)粒消除效率偏低,常用于低拷貝質(zhì)粒消除,對(duì)于中高拷貝質(zhì)粒消除效果不佳。且同個(gè)細(xì)胞內(nèi)同種復(fù)制子一般只能同時(shí)服務(wù)一種質(zhì)粒,若用溫敏復(fù)制子服務(wù)多種質(zhì)粒則可能加劇質(zhì)粒的自發(fā)丟失,不利于相關(guān)實(shí)驗(yàn)或生產(chǎn)工作的開(kāi)展;

3、基于sacb基因質(zhì)粒消除能同時(shí)服務(wù)于多個(gè)質(zhì)粒,但當(dāng)多種質(zhì)粒存在細(xì)胞內(nèi)時(shí),基于sacb基因的質(zhì)粒消除方法無(wú)法準(zhǔn)確的消除特定種類(lèi)的質(zhì)粒,且其對(duì)突變的耐受能力較弱,容易出現(xiàn)失效的情況;

4、crispr蛋白相關(guān)質(zhì)粒消除。基于crispr蛋白的質(zhì)粒消除技術(shù)能夠同時(shí)消除多種質(zhì)粒,并自由選擇需要消除的質(zhì)粒種類(lèi),但基于crispr蛋白的質(zhì)粒消除技術(shù)存在crispr蛋白基因突變失效或crispr蛋白切割脫靶的風(fēng)險(xiǎn),且crispr相關(guān)蛋白元件基因序列較長(zhǎng),不利于在難以轉(zhuǎn)入大質(zhì)粒的底盤(pán)微生物中使用。當(dāng)?shù)妆P(pán)細(xì)胞內(nèi)無(wú)天然crispr蛋白可利用時(shí),需要額外的轉(zhuǎn)入帶有crispr蛋白的質(zhì)粒,而帶crispr蛋白的質(zhì)粒自靶向消除失敗率較高。


技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明提出了一種基于反義rna的質(zhì)粒消除技術(shù),設(shè)計(jì)了質(zhì)粒消除模塊,該模塊能促進(jìn)細(xì)胞中游離型質(zhì)粒發(fā)生丟失,能高效實(shí)現(xiàn)多種游離型質(zhì)粒的選擇消除或同步消除,能應(yīng)用于真核、原核細(xì)胞中的不同種類(lèi)(拷貝數(shù))游離型質(zhì)粒的選擇消除或同步消除,對(duì)于序列突變的耐受性?xún)?yōu)于基于crispr蛋白的質(zhì)粒消除技術(shù)。相關(guān)蛋白元件基因序列長(zhǎng)度小于crispr,對(duì)于難以轉(zhuǎn)入大質(zhì)粒的底盤(pán)細(xì)胞依然適用。

2、針對(duì)代謝關(guān)鍵基因設(shè)計(jì)的反義rna,可以降低該代謝關(guān)鍵基因的表達(dá),從而影響細(xì)胞生長(zhǎng)速率。在細(xì)胞擴(kuò)增和傳代時(shí),質(zhì)粒隨機(jī)分配到子代,含有這種消除模塊的質(zhì)粒的子代細(xì)胞數(shù)量會(huì)越來(lái)越少,不含有該消除模塊的質(zhì)粒的子代細(xì)胞因生長(zhǎng)迅速會(huì)變得越來(lái)越多,從而達(dá)到富集無(wú)質(zhì)粒細(xì)胞實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒消除的目的。

3、本發(fā)明設(shè)計(jì)的質(zhì)粒消除模塊,除反義rna表達(dá)區(qū)域須部署在待消除質(zhì)粒上以外,其余區(qū)域部署于待消除質(zhì)粒所在的細(xì)胞內(nèi)即可。完成部署后,本發(fā)明設(shè)計(jì)的質(zhì)粒消除模塊可在部署范圍內(nèi)高效的實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒消除。

4、本發(fā)明的意義在于提出了一種便捷可用、可編程、適應(yīng)性廣、穩(wěn)定性強(qiáng)、所需序列較短的通用的質(zhì)粒消除模塊構(gòu)建思路,在滿(mǎn)足前置條件的情況下,該質(zhì)粒消除模塊可用于基因工程菌構(gòu)建后的構(gòu)建質(zhì)粒消除、人工構(gòu)建的質(zhì)粒消除。

5、為了實(shí)現(xiàn)上述目標(biāo),本發(fā)明采用如下的技術(shù)方案:

6、根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例,一種基于級(jí)聯(lián)反應(yīng)的質(zhì)粒消除模塊,包括三類(lèi)相互獨(dú)立的表達(dá)區(qū)域,其中一類(lèi)區(qū)域?yàn)榉戳xrna表達(dá)區(qū)域,包括反義rna、反義rna的啟動(dòng)子及終止子構(gòu)成;所述反義rna為代謝關(guān)鍵基因mrna的反義rna,能與代謝關(guān)鍵基因mrna結(jié)合阻礙代謝關(guān)鍵基因mrna翻譯;一類(lèi)區(qū)域?yàn)榉戳x中和rna表達(dá)區(qū)域,包括反義中和rna、反義中和rna的誘導(dǎo)型啟動(dòng)子及終止子構(gòu)成;最后一類(lèi)區(qū)域?yàn)檗D(zhuǎn)錄因子區(qū)域,由轉(zhuǎn)錄因子片段自帶的組成型啟動(dòng)子,其包括rna聚合酶結(jié)合位點(diǎn)及轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)、核糖體結(jié)合位點(diǎn)、轉(zhuǎn)錄因子翻譯區(qū)、終止子構(gòu)成;所述反義中和rna是與反義rna序列互補(bǔ),能結(jié)合反義rna使之無(wú)法與代謝關(guān)鍵基因mrna結(jié)合并抑制反義rna對(duì)代謝關(guān)鍵基因mrna產(chǎn)生翻譯阻礙的rna片段。

7、根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例,述的轉(zhuǎn)錄因子為能與特定化合物結(jié)合后,誘導(dǎo)結(jié)合位點(diǎn)下游基因轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì);或未與特定化合物結(jié)合前能誘導(dǎo)下游基因轉(zhuǎn)錄,與特定化合物結(jié)合后無(wú)法誘導(dǎo)結(jié)合位點(diǎn)下游基因轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)。

8、根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例,所述的轉(zhuǎn)錄因子為阿拉伯糖轉(zhuǎn)錄因子。

9、根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例,所述的轉(zhuǎn)錄因子片段自帶的組成型啟動(dòng)子為阿拉伯糖轉(zhuǎn)錄因子自帶組成型啟動(dòng)子。

10、根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例,所述的反義rna啟動(dòng)子包括j23119啟動(dòng)子、t7、tet、trc、trp、tac以及谷氨酸桿菌常用抗生素氯霉素、卡那霉素、青霉素抗性基因相關(guān)的的組成型啟動(dòng)子、或tef1啟動(dòng)子,所述反義rna終止子包括cyc1終止子、rrnb?t1終止子或rrnb?t2終止子。

11、根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例,所述的反義中和rna誘導(dǎo)型啟動(dòng)子包括gal1啟動(dòng)子、阿拉伯糖啟動(dòng)子,所述反義rna終止子包括cyc1終止子、rrnb?t1終止子或t7終止子。

12、根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例,所述的質(zhì)粒消除模塊搭載于待消除質(zhì)粒中。

13、根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例,所述的待消除質(zhì)粒包括pet28a、pec-xk99e、酵母2μ質(zhì)粒中任意一項(xiàng)。

14、根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例,所述的代謝關(guān)鍵基因?yàn)閠ca循環(huán)相關(guān)基因、蛋白質(zhì)合成相關(guān)基因、有氧呼吸相關(guān)基因、無(wú)氧呼吸相關(guān)基因、脂質(zhì)合成相關(guān)基因、細(xì)胞壁合成相關(guān)基因、糖類(lèi)轉(zhuǎn)運(yùn)途徑相關(guān)基因、氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)途徑相關(guān)基因、atp合成相關(guān)基因、細(xì)胞骨架合成相關(guān)基因、nadph/nadp+合成相關(guān)基因、nadh/nad+合成相關(guān)基因、維生素合成相關(guān)基因、一碳轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)相關(guān)基因、二氧化碳固定相關(guān)基因、dna/rna合成相關(guān)基因、氨基酸合成相關(guān)基因、核糖合成相關(guān)基因、核糖體合成相關(guān)基因、核糖體組裝相關(guān)基因、氨酰trna合成酶相關(guān)基因及上述基因的同工酶基因。

15、根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例,所述質(zhì)粒消除模塊的消除對(duì)象為所有具備穩(wěn)定游離質(zhì)粒、游離質(zhì)粒有一定概率不會(huì)分配給子細(xì)胞、且游離質(zhì)粒消除后不會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞死亡或無(wú)法增殖的微生物、動(dòng)物或植物細(xì)胞。。

16、本發(fā)明提出的質(zhì)粒消除模塊設(shè)計(jì)思路是本發(fā)明創(chuàng)意的核心,該設(shè)計(jì)通過(guò)誘導(dǎo)增加含質(zhì)粒與不含質(zhì)粒的細(xì)胞生長(zhǎng)速率差異,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒消除。可應(yīng)用于所有存在自發(fā)丟失現(xiàn)象但自發(fā)丟失效率偏低的質(zhì)粒上。級(jí)聯(lián)反應(yīng)的特點(diǎn)使之便于組成多重信號(hào)系統(tǒng),進(jìn)行時(shí)序性的生物行為控制。

17、為便于本專(zhuān)業(yè)技術(shù)人員理解本發(fā)明,主要詞匯解釋如下:

18、基因電路:將特定的基因元件如啟動(dòng)子、終止子、蛋白質(zhì)翻譯區(qū)、特定蛋白質(zhì)結(jié)合區(qū)按照一定規(guī)律組合在一起單位點(diǎn)或多位點(diǎn)布置以實(shí)現(xiàn)特定功能的dna序列的組合。

19、便捷可用:該模塊可以以pcr產(chǎn)物/質(zhì)粒等形式保存,可通過(guò)吉布森組裝、金門(mén)克隆、酶切酶連、基因組編輯等形式插入細(xì)胞外或細(xì)胞內(nèi)的質(zhì)粒上。

20、可編程:該模塊的使用不受質(zhì)粒拷貝數(shù)限制,且可通過(guò)組合不同的調(diào)控蛋白在含有復(fù)數(shù)種質(zhì)粒的細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)選擇性消除。

21、適應(yīng)性廣:該模塊可通過(guò)密碼子優(yōu)化/替換相關(guān)控制的元件的形式跨物種使用。

22、穩(wěn)定性強(qiáng):即使反義rna與目的mrna存在一定的序列偏差也不影響本發(fā)明提出的模塊的功能。

23、所需序列較短:當(dāng)使用細(xì)胞本底調(diào)控因子時(shí),本發(fā)明提出的質(zhì)粒消除模塊序列總長(zhǎng)通??尚∮?kbp,甚至小于100bp,當(dāng)自帶調(diào)控因子時(shí),本發(fā)明提出的質(zhì)粒消除模塊序列總長(zhǎng)通常不會(huì)超過(guò)3kbp。

24、構(gòu)建質(zhì)粒:主要指搭在了基因組編輯必須功能蛋白用于輔助實(shí)現(xiàn)基因工程細(xì)胞基因組編輯目的的工具質(zhì)粒,這類(lèi)質(zhì)粒在完成工程細(xì)胞基因組編輯后通常需要消除,以避免在工程細(xì)胞應(yīng)用中引入或造成額外的突變。

25、人工構(gòu)建質(zhì)粒:主要是指不涉及基因組編輯的、人工搭建的表達(dá)同源/異源蛋白或一些功能基因電路的質(zhì)粒。

26、反義中和rna:與反義rna序列互補(bǔ),能結(jié)合反義rna使之無(wú)法與代謝關(guān)鍵基因mrna結(jié)合并抑制反義rna對(duì)代謝關(guān)鍵基因mrna翻譯的阻礙。

27、時(shí)序性:可控時(shí)間差的。

28、游離質(zhì)粒:能在細(xì)胞中自主輔助或隨基因組共同復(fù)制,能伴隨細(xì)胞增殖分配給子細(xì)胞,且能穩(wěn)定游離余基因組之外的線性或環(huán)狀雙鏈dna。

29、質(zhì)粒的骨架:搭載質(zhì)粒復(fù)制子與質(zhì)粒維持基因的dna序列。

30、組成型啟動(dòng)子:能被大腸桿菌σ因子識(shí)別并招募rna聚合酶亞基對(duì)下游進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的特定dna序列。

31、舉例說(shuō)明如下:

32、大腸桿菌相關(guān)序列:

33、大腸桿菌acnb基因干擾區(qū)全序列:

34、actatgacaatgagagcgaggagaaccgtcgtgctagaagaataccgtaagcacgtagctgagcgtgccgctgaggggattgcgcccaaacccctggatgcaaaccaaatggccgcacttgtagagctgctgaaaaacccgcccgcgggcgaagaagaattcctgttagatctgttaaccaaccgtgttcccccaggcgtcgatgaagccgcctatgtcaaagcaggcttcctggctgctatcgctaaaggcgaagccaaatcccctctgctgactccggaaaaagccatcgaactgctgggcaccatgcagggtggttacaacattcatccgctgatcgacgcgctggatgatgccaaactggcaccgatcgctgccaaagcactttctcacacactgctgatgttcgataacttctatgacgtagaagagaaagcgaaagcaggcaacgaatatgcgaagcaggtaatgcagtcctgggcggatgccgaatggttcctgaatcgcccggcgctggctgaaaaactgaccgttaccgtcttcaaagtcactggcgaaaccaacaccgatgacctctctccggcaccggatgcgtggtcacgcccggatatcccactgcacgcgctggcgatgctgaaaaacgcccgtgaaggcatcgagccagaccagccaggtgttgttggtccgatcaagcaaatcgaagctctgcaacagaaaggtttcccgctggcgtacgtcggtgacgttgtgggtacgggttcatcgcgtaaatccgccacgaactccgtactgtggtttatgggtgatgatattccacatgtgccgaacaaacgcggcggtggtttgtgcctcggcggtaaaattgcaccaatcttctttaacacaatggaagacgcaggtgcactgccaatcgaagtcgacgtctctaacctgaacatgggcgacgtaattgacgtttacccgtacaaaggtgaagtgcgtaaccacgaaaccggcgaactgctggcgaccttcgaactgaaaaccgacgtgctgattgatgaagtgcgtgctggcggccgtattccgctgattattgggcgtggcctgaccaccaaagcgcgtgaagcacttggtctgccgcacagtgatgtgttccgtcaggcgaaagatgtcgctgagagcgatcgcggcttctcgctggcgcaaaaaatggtaggccgtgcctgtggcgtgaaaggcattcgtccgggcgcgtactgcgaaccgaaaatgacttctgtaggctctcaggacaccaccggcccgatgacccgtgatgaactgaaagacctggcgtgcctgggcttctcggctgacctggtgatgcagtctttctgccacaccgcggcgtatccgaagccagttgacgtgaacacgcaccacacgctgccggacttcattatgaaccgtggcggtgtgtcgctgcgtccgggtgacggcgtcattcactcctggctgaaccgtatgctgctgccggataccgtcggtaccggtggtgactcccatacccgtttcccgatcggtatctctttcccggcgggttctggtctggtggcgtttgctgccgcaactggcgtaatgccgctggatatgccggaatccgttctggtgcgcttcaaaggcaaaatgcagccgggcatcaccctgcgcgatctggtacacgcgatcccgctgtatgcgatcaaacaaggtctgctgaccgttgagaagaaaggcaagaaaaacatcttctctggccgcatcctggaaattgaaggtctgccggatctgaaagttgagcaggcctttgagctaaccgatgcgtccgccgagcgttctgccgctggttgtaccatcaagctgaacaaagaaccgatcatcgaatacctgaactctaacatcgtcctgctgaagtggatgatcgcggaaggttacggcgatcgtcgtaccctggaacgtcgtattcagggcatggaaaaatggctggcgaatcctgagctgctggaagccgatgcagatgcggaatacgcggcagtgatcgacatcgatctggcggatattaaagagccaatcctctgtgcaccgaacgacccggacgacgcacgtccgctgtctgcggtacagggcgagaagatcgacgaagtgtttatcggttcctgcatgaccaacatcggtcacttccgtgctgcgggtaaactgctggatgcgcacaaaggccagttgccgacgcgcctgtgggtggcaccgccaacccgtatggatgccgcgcagttgaccgaagaaggctactatagcgtcttcggtaagagcggtgcgcgtatcgagatccctggctgttccctgtgtatgggtaaccaggcgcgtgtagcagacggtgcgacggtggtttccacctctacccgtaacttcccgaaccgtctggggactggcgcgaatgtcttcctggcttctgcggaactggcggctgttgcggcgctgattggcaaactgccgacgccggaagagtaccagacctacgtggcgcaagtagataaaactgccgttgatacttatcgttatctgaacttcaaccagctttctcagtacaccgaaaaagccgatggggtgattttccagactgcggtttaa(seq?id?no:1)

35、pet28a質(zhì)粒全序列:

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101、caaccagcatcgcagtgggaacgatgccctcattcagcatttgcatggtttgttgaaaa

102、ccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtg

103、agatatttatgccagccagccagacgcagacgcgccgagacagaacttaatgggcccgc

104、taacagcgcgatttgctggtgacccaatgcgaccagatgctccacgcccagtcgcgtac

105、cgtcttcatgggagaaaataatactgttgatgggtgtctggtcagagacatcaagaaat

106、aacgccggaacattagtgcaggcagcttccacagcaatggcatcctggtcatccagcgg

107、atagttaatgatcagcccactgacgcgttgcgcgagaagattgtgcaccgccgctttac

108、aggcttcgacgccgcttcgttctaccatcgacaccaccacgctggcacccagttgatcg

109、gcgcgagatttaatcgccgcgacaatttgcgacggcgcgtgcagggccagactggagg

110、tggcaacgccaatcagcaacgactgtttgcccgccagttgttgtgccacgcggttggga

111、atgtaattcagctccgccatcgccgcttccactttttcccgcgttttcgcagaaacgtgg

112、ctggcctggttcaccacgcgggaaacggtctgataagagacaccggcatactctgcgac

113、atcgtataacgttactggtttcacattcaccaccctgaattgactctcttccgggcgctat

114、catgccataccgcgaaaggttttgcgccattcgatggtgtccgggatctcgacgctctcc

115、cttatgcgactcctgcattaggaagcagcccagtagtaggttgaggccgttgagcaccg

116、ccgccgcaaggaatggtgcatgcaaggagatggcgcccaacagtcccccggccacggg

117、gcctgccaccatacccacgccgaaacaagcgctcatgagcccgaagtggcgagcccga

118、tcttccccatcggtgatgtcggcgatataggcgccagcaaccgcacctgtggcgccggt

119、gatgccggccacgatgcgtccggcgtagaggatcgagatctcgatcccgcgaaattaat

120、acgactcactataggggaattgtgagcggataacaattcccctctagaaataattttgtt

121、taactttaagaaggagatataccatgtaacaaagcccgaaaggaagctgagttggctgc

122、tgccaccgctgagcaataactagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttgctgaaaggaggaactatatccggat(seq?id?no:2)

123、阿拉伯糖啟動(dòng)子序列(箭頭為轉(zhuǎn)錄起始方向):

124、aagaaaccaattgtccatattgcatcagacattgccgtcactgcgtcttttactggctcttctcgctaaccaaaccggtaaccccgcttattaaaagcattctgtaacaaagcgggaccaaagccatgacaaaaacgcgtaacaaaagtgtctataatcacggcagaaaagtccacattgattatttgcacggcgtcacactttgctatgccatagcatttttatccataagattagcggatcctacctgacgctttttatcgcaactctctactgtttctccat→(seq?idno:3)

125、t7終止子序列(箭頭為轉(zhuǎn)錄終止方向):

126、→ctagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttg(seq?id?no:4)

127、阿拉伯糖轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)框(包含啟動(dòng)子、cds區(qū)、終止子):

128、ggatttctgttcatgggggtaatgataccgatggcgcacatttccccgaaaagtgccacctgcatcgatttattatgacaacttgacggctacatcattcactttttcttcacaaccggcacggaactcgctcgggctggccccggtgcattttttaaatacccgcgagaaatagagttgatcgtcaaaaccaacattgcgaccgacggtggcgataggcatccgggtggtgctcaaaagcagcttcgcctggctgatacgttggtcctcgcgccagcttaagacgctaatccctaactgctggcggaaaagatgtgacagacgcgacggcgacaagcaaacatgctgtgcgacgctggcgatatcaaaattgctgtctgccaggtgatcgctgatgtactgacaagcctcgcgtacccgattatccatcggtggatggagcgactcgttaatcgcttccatgcgccgcagtaacaattgctcaagcagatttatcgccagcagctccgaatagcgcccttccccttgcccggcgttaatgatttgcccaaacaggtcgctgaaatgcggctggtgcgcttcatccgggcgaaagaaccccgtattggcaaatattgacggccagttaagccattcatgccagtaggcgcgcggacgaaagtaaacccactggtgataccattcgcgagcctccggatgacgaccgtagtgatgaatctctcctggcgggaacagcaaaatatcacccggtcggcaaacaaattctcgtccctgatttttcaccaccccctgaccgcgaatggtgagattgagaatataacctttcattcccagcggtcggtcgataaaaaaatcgagataaccgttggcctcaatcggcgttaaacccgccaccagatgggcattaaacgagtatcccggcagcaggggatcattttgcgcttcagccatacttttcatactcccgccattcagagaagaaaccaattgtccatattgcatcagacattgccgtcactgcgtcttttactggctcttctcgctaaccaaaccggtaaccccgcttattaaaagcattctgtaacaaagcgggaccaaagccatgacaaaaacgcgtaacaaaagtgtct(seq?id?no:5)

129、j23119啟動(dòng)子:

130、ttgacagctagctcagtcctaggtataatgctagc→(seq?id?no:6)

131、rrnb?t1終止子:

132、caaataaaacgaaaggctcagtcgaaagactgggcctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctc(seq?id?no:7)

133、谷氨酸棒桿菌相關(guān)序列:

134、谷氨酸棒桿菌acn基因cds區(qū)全序列:

135、ttggagctcactgtgactgaaagcaagaactccttcaatgctaagagcacccttgaagttggcgacaagtcctatgactacttcgccctctctgcagtgcctggcatggagaagctgccgtactccctcaaggttctcggagagaaccttcttcgtaccgaagacggcgcaaacatcaccaacgagcacattgaggctatcgccaactgggatgcatcttccgatccaagcatcgaaatccagttcaccccagcccgtgttctcatgcaggacttcaccggtgtcccttgtgtagttgacctcgcaaccatgcgtgaggcagttgctgcactcggtggcgaccctaacgacgtcaacccactgaacccagccgagatggtcattgaccactccgtcatcgtggaggctttcggccgcccagatgcactggctaagaacgttgagatcgagtacgagcgcaacgaggagcgttaccagttcctgcgttggggttccgagtccttctccaacttccgcgttgttcctccaggaaccggtatcgtccaccaggtcaacattgagtacttggctcgcgtcgtcttcgacaacgagggccttgcatacccagatacctgcatcggtaccgactcccacaccaccatggaaaacggcctgggcatcctgggctggggcgttggtggcattgaggctgaagcagcaatgctcggccagccagtgtccatgctgatccctcgcgttgttggcttcaagttgaccggcgagatcccagtaggcgttaccgcaactgacgttgtgctgaccatcaccgaaatgctgcgcgaccacggcgtcgtccagaagttcgttgagttctacggctccggtgttaaggctgttccactggctaaccgtgcaaccatcggcaacatgtccccagagttcggctccacctgtgcgatgttcccaatcgacgaggagaccaccaagtacctgcgcctcaccggccgcccagaagagcaggttgcactggtcgaggcttacgccaaggcgcagggcatgtggctcgacgaggacaccgttgaagctgagtactccgagtacctcgagctggacctgtccaccgttgttccttccatcgctggccctaagcgcccacaggaccgcatccttctctccgaggcaaaggagcagttccgtaaggatctgccaacctacaccgacgacgctgtttccgtagacacctccatccctgcaacccgcatggttaacgaaggtggcggacagcctgaaggcggcgtcgaagctgacaactacaacgcttcctgggctggctccggcgagtccttggctactggcgcagaaggacgtccttccaagccagtcaccgttgcatccccacagggtggcgagtacaccatcgaccacggcatggttgcaattgcatccatcacctcttgcaccaacacctctaacccatccgtgatgatcggcgctggcctgatcgcacgtaaggcagcagaaaagggcctcaagtccaagccttgggttaagaccatctgtgcaccaggttcccaggttgtcgacggctactaccagcgcgcagacctctggaaggaccttgaggccatgggcttctacctctccggcttcggctgcaccacctgtattggtaactccggcccactgccagaggaaatctccgctgcgatcaacgagcacgacctgaccgcaaccgcagttttgtccggtaaccgtaacttcgagggacgtatctcccctgacgttaagatgaactacctggcatccccaatcatggtcattgcttacgcaatcgctggcaccatggacttcgacttcgagaacgaagctcttggacaggaccaggacggcaacgacgtcttcctgaaggacatctggccttccaccgaggaaatcgaagacaccatccagcaggcaatctcccgtgagctttacgaagctgactacgcagatgtcttcaagggtgacaagcagtggcaggaactcgatgttcctaccggtgacaccttcgagtgggacgagaactccacctacatccgcaaggcaccttacttcgacggcatgcctgtcgagccagtggcagtcaccgacatccagggcgcacgcgttctggctaagctcggcgactctgtcaccaccgaccacatctcccctgcttcctccattaagccaggtacccctgcagctcagtacttggatgagcacggtgtggaacgccacgactacaactccctgggttccaggcgtggtaaccacgaggtcatgatgcgcggcaccttcgccaacatccgcctccagaaccagctggttgacatcgcaggtggctacacccgcgacttcacccaggagggtgctccacaggcgttcatctacgacgcttccgtcaactacaaggctgctggcattccgctggtcgtcttgggcggcaaggagtacggcaccggttcttcccgtgactgggcagctaagggcactaacctgctcggaattcgcgcagttatcaccgagtccttcgagcgtattcaccgctccaacctcatcggtatgggcgttgtcccactgcagttccctgcaggcgaatcccacgagtccctgggccttgacggcaccgagaccttcgacatcaccggactgaccgcactcaacgagggcgagactcctaagactgtcaaggtcaccgcaaccaaggagaacggcgacgtcgtcgagttcgacgcagttgtccgcatcgacaccccaggtgaggctgactactaccgccacggcggcatcctgcagtacgtgctgcgtcagatggctgcttcttctaagtaa(seq?id?no:8)

136、谷氨酸棒桿菌pec-xk99e質(zhì)粒序列:

137、gaattcgagctcggtacccggggatcctctagagtcgacctgcaggcatgcaagcttggctgttttggcggatgagagaagattttcagcctgatacagattaaatcagaacgcagaagcggtctgataaaacagaatttgcctggcggcagtagcgcggtggtcccacctgaccccatgccgaactcagaagtgaaacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaataaaacgaaaggctcagtcgaaagactgggcctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctcctgagtaggacaaatccgccgggagcggatttgaacgttgcgaagcaacggcccggagggtggcgggcaggacgcc

138、cgccataaactgccaggcatcaaattaagcagaaggccatcctgacggatggccttttt

139、gcgtttctacaaactctttttgtttatttttctaaatacattcaaatatgtatccgctcatg

140、aattaattccgctagatgacgtgcggcttcgacctcctgggcgtggcgcttgttggcgc

141、gctcgcggctggctgcggcacgacacgcgtctgagcagtattttgcgcgccgtcctcgt

142、gggtcaggccggggtgggatcaggccaccgcagtaggcgcagctgatgcgatcctcca

143、ctactgcgcgtcctcctggcgctgccgagcacgcagctcgtcggccagctcttcaaggt

144、cggccacaagcgtttctaggtcgctcgcggcacttgcccagtcgcgtgatgctggcgcg

145、tctgtcgtatcgagggcgcggaaaaatccgatcaccgtttttaaatcgacggcggcatc

146、gagtgcgtcggactccagcgcgacatcggagagatccaccgctgatgcttcaggccag

147、ttttggtacttcgtcgtgaaggtcatgacaccattataacgaacgttcgttaaaaattct

148、agccccaattctgataatttcttccggcactcctgcgaaaacctgcgagacttcttgccc

149、agaaaaaacgccaagcgcagcggttaccgcactttttttccaggtgatttcaccctgac

150、cagcgaagcggcactttagtgcatgaggtgtgcccctggtttcccctctttggagggtt

151、caacccaaaaaagcacacaagcaaaaatgaaaatcatcatgagcaagttggtgcgaag

152、cagcaacgcgctagctccaaaaaggtctccaggatctcgaggagatttttgaggggga

153、gggagtcgaggaagagccagagcagaaggcggggaaccgttctctgccgacagcgtg

154、agccccccttaaaaatcaggccggggaggaaccggggagggatcagagctaggagcg

155、agacaccctaaagggggggaaccgttttctgctgacggtgtttcgtttattagttttcag

156、cccgtggatagcggagggtgagggcaagtgagagccagagcaaggacgggaccccta

157、aaggggggaaccgttttctgctgacggtgtttcgtttattagttttcagcccgtggacg

158、gccgcgtttagcttccattccaagtgcctttctgacttgttggatgcgcctttcactgac

159、acctagttcgcctgcaagctcacgagtcgagggatcagcaaccgattgagaacgggca

160、tccaggatcgcagttttgacgcgaagttcgagcaactcgcctgtcatttctcggcgttt

161、gtttgcttccgctaatcgctgtcgcgtctcctgcgcatacttactttctgggtcagcccat

162、ctgcgtgcattcgatgtagctgcgccccgtcgccccatcgtcgctagagctttccgccct

163、cggctgctctgcgtttccacccgacgagcagggacgactggctggcctttagccacgta

164、gccgcgcacacgacgcgccatcgtcaggcgatcacgcatggcgggaagatccggctcc

165、cggccgtctgcaccgaccgcctgggcaacgttgtacgccacttcatacgcgtcgatgat

166、cttggcatcttttaggcgctcaccagcagctttgagctggtatcccacggtcaacgcgt

167、ggcgaaacgcggtctcgtcgcgcgctcgctctggatttgtccagagcactcgcacgccg

168、tcgatcaggtcgccggacgcgtccagggcgctcggcaggctcgcgtccaaaatcgcta

169、gcgccttggcttctgcggtggcgcgttgtgccgcttcaatgcgggcgcgtccgctggaa

170、aagtcctgctcaatgtactttttcggcttctgtgatccggtcatcgttcgagcaatctcca

171、ttaggtcggccagccgatccacacgatcatgctggcagtgccatttataggctgtcggat

172、cgtctgagacgtgcagcggccaccggctcagcctatgcgaaaaagcctggtcagcgcc

173、gaaaacacgagtcatttcttccgtcgttgcagccagcaggcgcatatttgggctggtttt

174、acctgctgcggcatacaccgggtcaatgagccagatgagctggcatttcccgctcagcg

175、gattcacgccgatccaagccggcgctttttctaggcgtgcccatttctctaaaatcgcgt

176、agacctgcgggtttacgtgctcaatcttcccgccggcctggtggctgggcacatcgatg

177、tcaagcacgatcaccgcggcatgttgcgcgtgcgtcagcgcaacgtactggcaccgcgt

178、cagcgcttttgagccagcccggtagagctttggttgggtttcgccggtatccgggttttt

179、aatccaggcgctcgcgaaatctcttgtcttgctgccctggaagctttcgcgtcccaggt

180、gagcgagcagttcgcggcgatcttctgccgtccagccgcgtgagccgcagcgcatagct

181、tcggggtgggtgtcgaacagatcggcggacaatttccacgcgctagctgtgactgtgtc

182、ctgcggatcggctagagtcatgtcttgagtgctttctcccagctgatgactgggggttag

183、ccgacgccctgtgagttcccgctcacggggcgttcaactttttcaggtatttgtgcagct

184、tatcgtgttttcttcgtaaatgaacgcttaactaccttgttaaacgtggcaaataggcag

185、gattgatggggatctagcttcacgctgccgcaagcactcagggcgcaagggctgctaaa

186、ggaagcggaacacgtagaaagccagtccgcagaaacggtgctgaccccggatgaatgt

187、cagctactgggctatctggacaagggaaaacgcaagcgcaaagagaaagcaggtagct

188、tgcagtgggcttacatggcgatagctagactgggcggttttatggacagcaagcgaacc

189、ggaattgccagctggggcgccctctggtaaggttgggaagccctgcaaagtaaactgg

190、atggctttcttgccgccaaggatctgatggcgcaggggatcaagatctgatcaagagac

191、aggatgaggatcgtttcgcatgattgaacaagatggattgcacgcaggttctccggccg

192、cttgggtggagaggctattcggctatgactgggcacaacagacaatcggctgctctgat

193、gccgccgtgttccggctgtcagcgcaggggcgcccggttctttttgtcaagaccgacct

194、gtccggtgccctgaatgaactccaagacgaggcagcgcggctatcgtggctggccacg

195、acgggcgttccttgcgcagctgtgctcgacgttgtcactgaagcgggaagggactggc

196、tgctattgggcgaagtgccggggcaggatctcctgtcatctcaccttgctcctgccgag

197、aaagtatccatcatggctgatgcaatgcggcggctgcatacgcttgatccggctacctgc

198、ccattcgaccaccaagcgaaacatcgcatcgagcgagcacgtactcggatggaagccg

199、gtcttgtcgatcaggatgatctggacgaagagcatcaggggctcgcgccagccgaactg

200、ttcgccaggctcaaggcgcggatgcccgacggcgaggatctcgtcgtgacccatggcga

201、tgcctgcttgccgaatatcatggtggaaaatggccgcttttctggattcatcgactgtgg

202、ccggctgggtgtggcggaccgctatcaggacatagcgttggctacccgtgatattgctg

203、aagagcttggcggcgaatgggctgaccgcttcctcgtgctttacggtatcgccgctccc

204、gattcgcagcgcatcgccttctatcgccttcttgacgagttcttctgagcgggactctgg

205、ggttcgcggaatcatgaccaaaatcccttaacgtgagttttcgttccactgagcgtcag

206、accccgtagaaaagatcaaaggatcttcttgagatcctttttttctgcgcgtaatctgct

207、gcttgcaaacaaaaaaaccaccgctaccagcggtggtttgtttgccggatcaagagct

208、accaactctttttccgaaggtaactggcttcagcagagcgcagataccaaatactgtcc

209、ttctagtgtagccgtagttaggccaccacttcaagaactctgtagcaccgcctacatacc

210、tcgctctgctaatcctgttaccagtggctgctgccagtggcgataagtcgtgtcttaccg

211、ggttggactcaagacgatagttaccggataaggcgcagcggtcgggctgaacgggggg

212、ttcgtgcacacagcccagcttggagcgaacgacctacaccgaactgagatacctacagc

213、gtgagctatgagaaagcgccacgcttcccgaagggagaaaggcggacaggtatccggt

214、aagcggcagggtcggaacaggagagcgcacgagggagcttccagggggaaacgcctg

215、gtatctttatagtcctgtcgggtttcgccacctctgacttgagcgtcgatttttgtgatgc

216、tcgtcaggggggcggagcctatggaaaaacgccagcaacgcggcctttttacggttcct

217、ggccttttgctggccttttgctcacatgttctttcctgcgttatcccctgattctgtggat

218、aaccgtattaccgcctttgagtgagctgataccgctcgccgcagccgaacgaccgagcg

219、cagcgagtcagtgagcgaggaagcggaagagcgcctgatgcggtattttctccttacgc

220、atctgtgcggtatttcacaccgcatatggtgcactctcagtacaatctgctctgatgccgc

221、atagttaagccagtatacactccgctatcgctacgtgactgggtcatggctgcgccccga

222、cacccgccaacacccgctgacgcgccctgacgggcttgtctgctcccggcatccgctta

223、cagacaagctgtgaccgtctccgggagctgcatgtgtcagaggttttcaccgtcatcac

224、cgaaacgcgcgaggcagcagatcaattcgcgcgcgaaggcgaagcggcatgcatttac

225、gttgacaccatcgaatggtgcaaaacctttcgcggtatggcatgatagcgcccggaaga

226、gagtcaattcagggtggtgaatgtgaaaccagtaacgttatacgatgtcgcagagtatg

227、ccggtgtctcttatcagaccgtttcccgcgtggtgaaccaggccagccacgtttctgcg

228、aaaacgcgggaaaaagtggaagcggcgatggcggagctgaattacattcccaaccgcg

229、tggcacaacaactggcgggcaaacagtcgttgctgattggcgttgccacctccagtctg

230、gccctgcacgcgccgtcgcaaattgtcgcggcgattaaatctcgcgccgatcaactggg

231、tgccagcgtggtggtgtcgatggtagaacgaagcggcgtcgaagcctgtaaagcggcg

232、gtgcacaatcttctcgcgcaacgcgtcagtgggctgatcattaactatccgctggatgac

233、caggatgccattgctgtggaagctgcctgcactaatgttccggcgttatttcttgatgtc

234、tctgaccagacacccatcaacagtattattttctcccatgaagacggtacgcgactgggc

235、gtggagcatctggtcgcattgggtcaccagcaaatcgcgctgttagcgggcccattaag

236、ttctgtctcggcgcgtctgcgtctggctggctggcataaatatctcactcgcaatcaaat

237、tcagccgatagcggaacgggaaggcgactggagtgccatgtccggttttcaacaaacc

238、atgcaaatgctgaatgagggcatcgttcccactgcgatgctggttgccaacgatcagat

239、ggcgctgggcgcaatgcgcgccattaccgagtccgggctgcgcgttggtgcggatatct

240、cggtagtgggatacgacgataccgaagacagctcatgttatatcccgccgtcaaccacca

241、tcaaacaggattttcgcctgctggggcaaaccagcgtggaccgcttgctgcaactctct

242、cagggccaggcggtgaagggcaatcagctgttgcccgtctcactggtgaaaagaaaaa

243、ccaccctggcgcccaatacgcaaaccgcctctccccgcgcgttggccgattcattaatgc

244、agctggcacgacaggtttcccgactggaaagcgggcagtgagcgcaacgcaattaatg

245、tgagttagcgcgaattgatctggtttgacagcttatcatcgactgcacggtgcaccaatg

246、cttctggcgtcaggcagccatcggaagctgtggtatggctgtgcaggtcgtaaatcact

247、gcataattcgtgtcgctcaaggcgcactcccgttctggataatgttttttgcgccgacat

248、cataacggttctggcaaatattctgaaatgagctgttgacaattaatcatccggctcgtataatgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagaccatg(seq?id?no:9)

249、阿拉伯糖啟動(dòng)子序列(箭頭為轉(zhuǎn)錄起始方向):

250、aagaaaccaattgtccatattgcatcagacattgccgtcactgcgtcttttactggctcttctcgctaaccaaaccggtaaccccgcttattaaaagcattctgtaacaaagcgggaccaaagccatgacaaaaacgcgtaacaaaagtgtctataatcacggcagaaaagtccacattgattatttgcacggcgtcacactttgctatgccatagcatttttatccataagattagcggatcctacctgacgctttttatcgcaactctctactgtttctccat→(seq?idno:10)

251、t7終止子序列(箭頭為轉(zhuǎn)錄終止方向):

252、→ctagcataaccccttggggcctctaaacgggtcttgaggggttttttg(seq?id?no:11)

253、阿拉伯糖轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)框(包含啟動(dòng)子、cds區(qū)、終止子):

254、ggatttctgttcatgggggtaatgataccgatggcgcacatttccccgaaaagtgccacctgcatcgatttattatgacaacttgacggctacatcattcactttttcttcacaaccggcacggaactcgctcgggctggccccggtgcattttttaaatacccgcgagaaatagagttgatcgtcaaaaccaacattgcgaccgacggtggcgataggcatccgggtggtgctcaaaagcagcttcgcctggctgatacgttggtcctcgcgccagcttaagacgctaatccctaactgctggcggaaaagatgtgacagacgcgacggcgacaagcaaacatgctgtgcgacgctggcgatatcaaaattgctgtctgccaggtgatcgctgatgtactgacaagcctcgcgtacccgattatccatcggtggatggagcgactcgttaatcgcttccatgcgccgcagtaacaattgctcaagcagatttatcgccagcagctccgaatagcgcccttccccttgcccggcgttaatgatttgcccaaacaggtcgctgaaatgcggctggtgcgcttcatccgggcgaaagaaccccgtattggcaaatattgacggccagttaagccattcatgccagtaggcgcgcggacgaaagtaaacccactggtgataccattcgcgagcctccggatgacgaccgtagtgatgaatctctcctggcgggaacagcaaaatatcacccggtcggcaaacaaattctcgtccctgatttttcaccaccccctgaccgcgaatggtgagattgagaatataacctttcattcccagcggtcggtcgataaaaaaatcgagataaccgttggcctcaatcggcgttaaacccgccaccagatgggcattaaacgagtatcccggcagcaggggatcattttgcgcttcagccatacttttcatactcccgccattcagagaagaaaccaattgtccatattgcatcagacattgccgtcactgcgtcttttactggctcttctcgctaaccaaaccggtaaccccgcttattaaaagcattctgtaacaaagcgggaccaaagccatgacaaaaacgcgtaacaaaagtgtct(seq?id?no:12)

255、trc啟動(dòng)子:

256、ttgacaattaatcatccggctcgtataatg→(seq?id?no:13)

257、rrnb?t2終止子:

258、→agaaggccatcctgacggatggcctttt(seq?id?no:14)

259、釀酒酵母相關(guān)序列:

260、釀酒酵母aco1/glu1基因cds區(qū)全序列:

261、atgctgtctgcacgttctgccatcaagagacccattgttcgtggtcttgcgacagtctccaacttgactagagattcaaaagtcaaccaaaacttattagaagatcattcttttattaactacaagcagaatgtggaaacgctggatatcgtaagaaaaagattaaacaggccatt

262、tacctacgcggaaaagattttgtacggtcacttggatgaccctcatggtcaagatattca

263、gagaggtgtttcatacctaaaattaagaccagatcgtgttgcctgtcaagatgctactgc

264、tcaaatggctattttacaatttatgtccgctggtttaccacaggttgctaagccagtcact

265、gtccactgtgaccatttgattcaagcacaagttggtggtgaaaaagatttgaagagagc

266、tatagatctaaacaaggaagtttatgatttcttggcctctgccactgcgaaatataacatg

267、ggtttctggaagccaggttccggtatcattcaccaaattgttctggaaaactacgctttc

268、ccaggtgctttgatcattggtactgactcccatacaccaaatgctggtggtttaggtcaa

269、ttggctattggtgttggtggtgctgatgccgttgatgttatggcaggtcgtccatgggaa

270、ttgaaggctccaaagatcttaggtgttaagttgactggtaagatgaacggttggacttc

271、tccaaaggatattattttgaaattggctggtatcacaactgtcaaaggtggtactggtaa

272、aattgttgaatatttcggtgatggtgttgacaccttctccgctactggtatgggtaccatt

273、tgtaatatgggtgctgaaatcggtgctaccacatctgttttcccattcaacaaatctatga

274、ttgaatatttggaagcaactggtcgtggtaagatcgctgactttgctaaattataccaca

275、aggacctattatctgctgataaggatgctgaatacgatgaggtcgtcgaaattgacttga

276、acactctggaaccatacatcaatgggccatttacccccgatttggctactccagtttcta

277、agatgaaggaagttgctgttgctaataactggccattggatgtcagagtcggtttgatc

278、ggttcttgtaccaattcctcttatgaagatatgtctcgttcagcatccattgtcaaggatg

279、ctgctgctcatggtttgaaatccaagaccattttcactgttactccaggttctgaacaaa

280、tcagagccactattgaacgtgatggccaattagaaaccttcaaagaatttggtggtatcg

281、ttttggcaaacgcctgtggcccatgtattggtcaatgggatcgtagagatatcaagaaag

282、gtgacaagaatactatcgtttcctcttacaacagaaatttcacttctagaaatgatggta

283、acccacaaactcatgcttttgttgcatctccagaattagtaactgcgttcgccattgcgg

284、gtgatttgagattcaaccctctaacagacaaattaaaggacaaggatggtaatgagttc

285、atgttgaaaccaccacatggtgatggtttgcctcaaagaggttatgatgctggtgagaa

286、cacttaccaagctccacctgcagaccgtagcaccgttgaagttaaagtttctccaactt

287、cagaccgtctacaactgttgaaaccattcaaaccttgggatggtaaggatgctaaagac

288、atgccaatcttgattaaggccgtcggtaagacaactactgatcatatttctatggctggtc

289、catggttgaaatacagaggtcatttagaaaacatttctaataactatatgattggtgctat

290、taatgctgaaaacaagaaggctaactgtgttaaaaatgtatatactggtgaatacaaag

291、gtgttccagacactgctagagattacagagaccaaggtatcaagtgggttgttattggt

292、gatgaaaactttggtgaaggttcctctcgtgaacacgctgctttggaaccaagattctt

293、gggcggtttcgctatcatcacaaagtctttcgctcgtatccatgaaactaacttgaaaaa

294、acaaggtctattgccattgaacttcaagaacccagctgactatgacaagatcaaccctg

295、atgacagaatcgatattctgggtctagctgaattggctccaggtaagcctgtaacaatga

296、gagttcatccaaagaatggtaagccatgggatgctgtgttgacccatactttcaacgatg

297、agcaaattgaatggttcaaatatggttctgccttaaataaaattaaggccgatgagaagaaataa(seqid?no:15)

298、釀酒酵母2u穿梭質(zhì)粒序列:

299、caactttgtatagaaaagttgacggattagaagccgccgagcgggtgacagccctccgaaggaagactctcctccgtgcgtcctcgtcttcaccggtcgcgttcctgaaacgcagatgtgcctcgcgccgcactgctccgaacaataaagattctacaatactagcttttatggttatgaagaggaaaaattggcagtaacctggccccacaaaccttcaaatgaacgaatcaaattaacaaccataggatgataatgcgattagttttttagccttatttctggggtaattaatcagcgaagcgatgatttttgatctattaacagatatataaatgcaaaaactgcataaccactttaactaatactttcaacattttcggtttgtattacttcttattcaaatgtaataaaagtatcaacaaaaaattgttaatatacctctatactttaacgtcaaggagaaaaaacccaagtttgtacaaaaaagcaggctgccaccatggtgagcaagggcgaggagctgttcaccggggtggtgcccatcctggtcgagctggacggcgacgtaaacggccacaagttcagcgtgtccggcgagggcgagggcgatgccacctacggcaagctgaccctgaagttcatctgcaccaccggcaagctgcccgtgccctggcccaccctcgtgaccaccctgacctacggcgtgcagtgcttcagccgctaccccgaccacatgaagcagcacgacttcttcaagtccgccatgcccgaaggctacgtccaggagcgcaccatcttcttcaaggacgacggcaactacaagacccgcgccgaggtgaagttcgagggcgacaccctggtgaaccgcatcgagctgaagggcatcgacttcaaggaggacggcaacatcctggggcacaagctggagtacaactacaacagccacaacgtctatatcatggccgacaagcagaagaacggcatcaaggtgaacttcaagatccgccacaacatcgaggacggcagcgtgcagctcgccgaccactaccagcagaacacccccatcggcgacggccccgtgctgctgcccgacaaccactacctgagcacccagtccgccctgagcaaagaccccaacgagaagcgcgatcacatggtcctgctggagttcgtgaccgccgccgggatcactctcggcatggacgagctgtacaagtaaacccagctttcttgtacaaagtggtagcggccgctcgagcatgcatctagagggccgcatcatgtaattagttatgtcacgcttacattcacgccctccccccacatccgctctaaccgaaaaggaaggagttagacaacctgaagtctaggtccctatttatttttttatagttatgttagtattaagaacgttat

300、ttatatttcaaatttttcttttttttctgtacagacgcgtgtacgcatgtaacattatactg

301、aaaaccttgcttgagaaggttttgggacgctcgaaggctttaatttgcaagctgcggcc

302、ctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgggcgctcttc

303、cgcttcctcgctcactgactcgctgcgctcggtcgttcggctgcggcgagcggtatcag

304、ctcactcaaaggcggtaatacggttatccacagaatcaggggataacgcaggaaagaac

305、atgtgagcaaaaggccagcaaaaggccaggaaccgtaaaaaggccgcgttgctggcg

306、tttttccataggctccgcccccctgacgagcatcacaaaaatcgacgctcaagtcagag

307、gtggcgaaacccgacaggactataaagataccaggcgtttccccctggaagctccctcg

308、tgcgctctcctgttccgaccctgccgcttaccggatacctgtccgcctttctcccttcgg

309、gaagcgtggcgctttctcatagctcacgctgtaggtatctcagttcggtgtaggtcgttc

310、gctccaagctgggctgtgtgcacgaaccccccgttcagcccgaccgctgcgccttatcc

311、ggtaactatcgtcttgagtccaacccggtaagacacgacttatcgccactggcagcagc

312、cactggtaacaggattagcagagcgaggtatgtaggcggtgctacagagttcttgaagt

313、ggtggcctaactacggctacactagaagaacagtatttggtatctgcgctctgctgaag

314、ccagttaccttcggaaaaagagttggtagctcttgatccggcaaacaaaccaccgctgg

315、tagcggtggtttttttgtttgcaagcagcagattacgcgcagaaaaaaaggatctcaag

316、aagatcctttgatcttttctacggggtctgacgctcagtggaacgaaaactcacgttaa

317、gggattttggtcatgagattatcaaaaaggatcttcacctagatccttttaaattaaaaat

318、gaagttttaaatcaatctaaagtatatatgagtaaacttggtctgacagttaccaatgctt

319、aatcagtgaggcacctatctcagcgatctgtctatttcgttcatccatagttgcctgactc

320、cccgtcgtgtagataactacgatacgggagggcttaccatctggccccagtgctgcaatg

321、ataccgcgagacccacgctcaccggctccagatttatcagcaataaaccagccagccgg

322、aagggccgagcgcagaagtggtcctgcaactttatccgcctccatccagtctattaattg

323、ttgccgggaagctagagtaagtagttcgccagttaatagtttgcgcaacgttgttgccat

324、tgctacaggcatcgtggtgtcacgctcgtcgtttggtatggcttcattcagctccggttc

325、ccaacgatcaaggcgagttacatgatcccccatgttgtgcaaaaaagcggttagctcct

326、tcggtcctccgatcgttgtcagaagtaagttggccgcagtgttatcactcatggttatgg

327、cagcactgcataattctcttactgtcatgccatccgtaagatgcttttctgtgactggtga

328、gtactcaaccaagtcattctgagaatagtgtatgcggcgaccgagttgctcttgcccgg

329、cgtcaatacgggataataccgcgccacatagcagaactttaaaagtgctcatcattggaa

330、aacgttcttcggggcgaaaactctcaaggatcttaccgctgttgagatccagttcgatg

331、taacccactcgtgcacccaactgatcttcagcatcttttactttcaccagcgtttctggg

332、tgagcaaaaacaggaaggcaaaatgccgcaaaaaagggaataagggcgacacggaaa

333、tgttgaatactcatactcttcctttttcaatgggtaataactgatataattaaattgaagct

334、ctaatttgtgagttgagtatacatgcatttacttataatacagtttttcagaagaactcgt

335、caagaaggcgatagaaggcgatgcgctgcgaatcgggagcggcgataccgtaaagcac

336、gaggaagcggtcagcccattcgccgccaagctcttcagcaatatcacgggtagccaacg

337、ctatgtcctgatagcggtccgccacacccagccggccacagtcgatgaatccagaaaag

338、cggccattttccaccatgatattcggcaagcaggcatcgccatgggtcacgacgagatcc

339、tcgccgtcgggcatgctcgccttgagcctggcgaacagttcggctggcgcgagcccctg

340、atgctcttcgtccagatcatcctgatcgacaagaccggcttccatccgagtacgtgctcg

341、ctcgatgcgatgtttcgcttggtggtcgaatgggcaggtagccggatcaagcgtatgca

342、gccgccgcattgcatcagccatgatggatactttctcggcaggagcaaggtgagatgac

343、aggagatcctgccccggcacttcgcccaatagcagccagtcccttcccgcttcagtgac

344、aacgtcgagcacagctgcgcaaggaacgcccgtcgtggccagccacgatagccgcgct

345、gcctcgtcttgcagttcattcagggcaccggacaggtcggtcttgacaaaaagaaccg

346、ggcgcccctgcgctgacagccggaacacggcggcatcagagcagccgattgtctgttg

347、tgcccagtcatagccgaatagcctctccacccaagcggccggagaacctgcgtgcaatc

348、catcttgttcaatcatgatttatcttcgtttcctgcaggtttttgttctgtgcagttgggtt

349、aagaatactgggcaatttcatgtttctttcaacactacatatgcgtatatataccaatctaa

350、gtctgtgctccttccttcgttcttccttctgttcggagattaccgaatcaaaaaaatttc

351、aaggaaaccgaaatcaaaaaaaagaataaaaaaaaaatgatgaattgaaaagctagct

352、tatcgatgataagctgtcaaacatgagaattaattccacggactatagactatacctagta

353、tactccgtctactgtacgatacacttccgctcaggtccttgtcctttaacgaggccttac

354、cactcttttgttactctattgatccagctcagcaaaggcagtgtgatctaagattctatct

355、tcgcgatgtagtaaaactagctagaccgagaaagagactagaaatgcaaaaggcactt

356、ctacaatggctgccatcattattatccgatgtgacgctgcagcttctcaatgatattcgaa

357、tacgctttgaggagatacagcctaatatccgacaaactgttttacagatttacgatcgta

358、cttgttacccatcattgaattttgaacatccgaacctgggagttttccctgaaacagata

359、gtatatttgaacctgtataataatatatagtctagcgctttacggaagacaatgtatgtatt

360、tcggttcctggagaaactattgcatctattgcataggtaatcttgcacgtcgcatccccg

361、gttcattttctgcgtttccatcttgcacttcaatagcatatctttgttaacgaagcatctg

362、tgcttcattttgtagaacaaaaatgcaacgcgagagcgctaatttttcaaacaaagaat

363、ctgagctgcatttttacagaacagaaatgcaacgcgaaagcgctattttaccaacgaag

364、aatctgtgcttcatttttgtaaaacaaaaatgcaacgcgagagcgctaatttttcaaaca

365、aagaatctgagctgcatttttacagaacagaaatgcaacgcgagagcgctattttacca

366、acaaagaatctatacttcttttttgttctacaaaaatgcatcccgagagcgctatttttct

367、aacaaagcatcttagattactttttttctcctttgtgcgctctataatgcagtctcttgat

368、aactttttgcactgtaggtccgttaaggttagaagaaggctactttggtgtctattttct

369、cttccataaaaaaagcctgactccacttcccgcgtttactgattactagcgaagctgcgg

370、gtgcattttttcaagataaaggcatccccgattatattctataccgatgtggattgcgcat

371、actttgtgaacagaaagtgatagcgttgatgattcttcattggtcagaaaattatgaacg

372、gtttcttctattttgtctctatatactacgtataggaaatgtttacattttcgtattgttttc

373、gattcactctatgaatagttcttactacaatttttttgtctaaagagtaatactagagata

374、aacataaaaaatgtagaggtcgagtttagatgcaagttcaaggagcgaaaggtggatg

375、ggtaggttatatagggatatagcacagagatatatagcaaagagatacttttgagcaatgt

376、ttgtggaagcggtattcgcaatgggaagctccaccccggttgataatcagaaaagcccc

377、aaaaacaggaagattgtataagcaaatatttaaattgtaagcgttaatattttgttaaaat

378、tcgcgttaaatttttgttaaatcagctcattttttaaccaataggccgaaatcggcaaaat

379、cccttataaatcaaaagaatagaccgagatagggttgagtgttgttccagtttggaaca

380、agagtccactattaaagaacgtggactccaacgtcaaagggcgaaaaaccgtctatca

381、gggcgatggcccactacgtgaaccatcaccctaatcaagttttttggggtcgaggtgcc

382、gtaaagcactaaatcggaaccctaaagggagcccccgatttagagcttgacggggaaa

383、gccggcgaacgtggcgagaaaggaagggaagaaagcgaaaggagcgggcgctaggg

384、cgctggcaagtgtagcggtcacgctgcgcgtaaccaccacacccgccgcgcttaatgcgccgctacagggcgcgtggggatcgatccactagt(seq?id?no:16)

385、釀酒酵母硫酸新霉素抗性基因序列(包含啟動(dòng)子、表達(dá)框、終止子):

386、gtgagttgagtatacatgcatttacttataatacagtttttcagaagaactcgtcaagaaggcgatagaaggcgatgcgctgcgaatcgggagcggcgataccgtaaagcacgaggaagcggtcagcccattcgccgccaagctcttcagcaatatcacgggtagccaacgctatgtcctgatagcggtccgccacacccagccggccacagtcgatgaatccagaaaagcggccattttccaccatgatattcggcaagcaggcatcgccatgggtcacgacgagatcctcgccgtcgggcatgctcgccttgagcctggcgaacagttcggctggcgcgagcccctgatgctcttcgtccagatcatcctgatcgacaagaccggcttccatccgagtacgtgctcgctcgatgcgatgtttcgcttggtggtcgaatgggcaggtagccggatcaagcgtatgcagccgccgcattgcatcagccatgatggatactttctcggcaggagcaaggtgagatgacaggagatcctgccccggcacttcgcccaatagcagccagtcccttcccgcttcagtgacaacgtcgagcacagctgcgcaaggaacgcccgtcgtggccagccacgatagccgcgctgcctcgtcttgcagttcattcagggcaccggacaggtcggtcttgacaaaaagaaccgggcgcccctgcgctgacagccggaacacggcggcatcagagcagccgattgtctgttgtgcccagtcatagccgaatagcctctccacccaagcggccggagaacctgcgtgcaatccatcttgttcaatcatgatttatcttcgtttcctgcaggtttttgttctgtgcagttgggttaagaatactgggcaatttcatgtttctttcaacactacatatgcgtatatataccaatctaagtctgtgctccttccttcgttcttccttctg(seq?idno:17)

387、穿梭載體大腸桿菌復(fù)制子序列:

388、tttccataggctccgcccccctgacgagcatcacaaaaatcgacgctcaagtcagaggtggcgaaacccgacaggactataaagataccaggcgtttccccctggaagctccctcgtgcgctctcctgttccgaccctgccgcttaccggatacctgtccgcctttctcccttcgggaagcgtggcgctttctcatagctcacgctgtaggtatctcagttcggtgtaggtcgttcgctccaagctgggctgtgtgcacgaaccccccgttcagcccgaccgctgcgccttatccggtaactatcgtcttgagtccaacccggtaagacacgacttatcgccactggcagcagccactggtaacaggattagcagagcgaggtatgtaggcggtgctacagagttcttgaagtggtggcctaactacggctacactagaagaacagtatttggtatctgcgctctgctgaagccagttaccttcggaaaaagagttggtagctcttgatccggcaaacaaaccaccgctggtagcggtggtttttttgtttgcaagcagcagattacgcgcagaaaaaaaggatctcaa(seq?id?no:18)

389、穿梭載體氨芐青霉素抗性基因表達(dá)框(包含啟動(dòng)子、表達(dá)框、終止子):

390、ggatcttcacctagatccttttaaattaaaaatgaagttttaaatcaatctaaagtatatatgagtaaacttggtctgacagttaccaatgcttaatcagtgaggcacctatctcagcgatctgtctatttcgttcatccatagttgcctgactccccgtcgtgtagataactacgatacgggagggcttaccatctggccccagtgctgcaatgataccgcgagacccacgctcaccggctccagatttatcagcaataaaccagccagccggaagggccgagcgcagaagtggtcctgcaactttatccgcctccatccagtctattaattgttgccgggaagctagagtaagtagttcgccagttaatagtttgcgcaacgttgttgccattgctacaggcatcgtggtgtcacgctcgtcgtttggtatggcttcattcagctccggttcccaacgatcaaggcgagttacatgatcccccatgttgtgcaaaaaagcggttagctccttcggtcctccgatcgttgtcagaagtaagttggccgcagtgttatcactcatggttatggcagcactgcataattctcttactgtcatgccatccgtaagatgcttttctgtgactggtgagtactcaaccaagtcattctgagaatagtgtatgcggcgaccgagttgctcttgcccggcgtcaatacgggataataccgcgccacatagcagaactttaaaagtgctcatcattggaaaacgttcttcggggcgaaaactctcaaggatcttaccgctgttgagatccagttcgatgtaacccactcgtgcacccaactgatcttcagcatcttttactttcaccagcgtttctgggtgagcaaaaacaggaaggcaaaatgccgcaaaaaagggaataagggcgacacggaaatgttgaatactcatactcttcctttttcaatgggtaataactgatataattaaattgaagctctaatttgtgagttgagtatacatgc(seq?id?no:19)

391、釀酒酵母誘導(dǎo)型啟動(dòng)子gal1序列:

392、acggattagagccgccgagcgacgagcgagcggagcgcagcagcgccgaaggaagactctcctccgtgcgctcctcgtctcgtcttcaccggtcgtcgtcctgaaacgagatgtgtgcctcgcgccgcactgctccgaacaataatacaataaagattctacaatactagctatggttatggttatgaagagaaaaatggcagtacctggccccaaacctcaaatgaacgaatcaattaacaaccataggatgatgataatgcgattagttagcttattctatttctggggtaattaatcagcgaagcgatgatgattttgatctattacagatatataatgcaaaactgcataaccacttaactaactaatataatactttcaacattttcgtgttgattacttcttatcaaatgtaatacaaaaattgtaatatatacctatactactactacttaacgtcaaggagacc(seq?id?no:20)

393、酵母終止子cyc1序列:

394、atcatgtaattagttatgtcacgcttacattcacgccctccccccacatccgctctaaccgaaaaggaaggagttagacaacctgaagtctaggtccctatttatttttttatagttatgttagtattaagaacgttatttatatttcaaatttttcttttttttctgtacagacgcgtgtacgcatgtaacattatactgaaaaccttgcttgagaaggttttgggacgctcgaaggctttaatttgcaagct(seq?id?no:21)

395、釀酒酵母組成型啟動(dòng)子tef1序列:

396、ccacacaccatagcttcaaaatgtttctactccttttttactcttccagattttctcggactccgcgcatcgccgtaccacttcaaaacacccaagcacagcatactaaatttcccctctttcttcctctagggtgtcgttaattacccgtactaaaggtttggaaaagaaaaaagagaccgcctcgtttctttttcttcgtcgaaaaaggcaataaaaatttttatcacgtttctttttcttgaaaatttttttttttgatttttttctctttcgatgacctcccattgatatttaagttaataaacggtcttcaatttctcaagtttcagtttcatttttcttgttctattacaactttttttacttcttgctcattagaaagaaagcatagcaatctaatctaag(seq?id?no:22)

397、本發(fā)明的有益效果在于:本發(fā)明設(shè)計(jì)了一種基于反義rna的、模塊化的質(zhì)粒消除技術(shù),構(gòu)建質(zhì)粒消除模塊所需元件簡(jiǎn)單易得,質(zhì)粒模塊消除效率高,可根據(jù)需要自由設(shè)置消除對(duì)象,可實(shí)現(xiàn)多種質(zhì)粒的選擇性或同步消除。且本發(fā)明應(yīng)用范圍廣,真核原核生物中均可應(yīng)用該技術(shù),中心代謝途徑相關(guān)基因皆可結(jié)合反義rna用于質(zhì)粒消除,中心代謝途徑之外的氨基酸、核酸、脂質(zhì)合成途徑、轉(zhuǎn)錄翻譯、dna復(fù)制、細(xì)胞壁、細(xì)胞膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等代謝相關(guān)基因的反義rna同樣可應(yīng)用于本技術(shù),若消除效果不佳還可通過(guò)增加反義rna種類(lèi)、延長(zhǎng)反義rna長(zhǎng)度等策略強(qiáng)化消除效果。

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